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中華蜜蜂6日齡幼蟲腸道響應(yīng)球囊菌脅迫的差異表達(dá)基因分析

發(fā)布時間:2018-10-24 15:35
【摘要】:蜜蜂球囊菌特異性侵染蜜蜂幼蟲而導(dǎo)致白堊病,嚴(yán)重危害養(yǎng)蜂生產(chǎn)。本研究利用RNA-seq技術(shù)對健康及球囊菌脅迫的中蜂幼蟲腸道進(jìn)行深度測序,進(jìn)而對宿主的差異表達(dá)基因進(jìn)行深入分析。本研究中,幼蟲腸道樣品的RNA-seq共得到191167730條原始讀段(raw reads),經(jīng)過濾得到186284296條有效讀段(clean reads),差異表達(dá)基因(DEG)分析結(jié)果顯示上調(diào)與下調(diào)基因的數(shù)量分別為4513和385個。Gene ontology(GO)富集分析結(jié)果顯示,上調(diào)基因富集在45個GO條目(term),富集基因數(shù)最多的是細(xì)胞進(jìn)程、代謝進(jìn)程及催化活性,下調(diào)基因富集在32個GO term,富集基因數(shù)最多的是代謝進(jìn)程、單組織進(jìn)程及催化活性,KEGG代謝通路(pathway)富集分析結(jié)果顯示上調(diào)基因富集在193個pathway,其中富集基因數(shù)最多的是核糖體、氨基酸的合成、碳代謝。下調(diào)基因富集在59個pathway,其中富集基因數(shù)最多的是甘氨酸、碳代謝以及二羧酸代謝。深入分析發(fā)現(xiàn)宿主的細(xì)胞免疫被顯著激活,體液免疫中的Toll-like與Jak-STAT信號通路也被球囊菌所激活。研究結(jié)果為揭示中蜂幼蟲在球囊菌入侵后期的脅迫應(yīng)答機(jī)制提供了重要的信息,也為解析中蜂幼蟲的球囊菌抗性機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:Bee Balloon bacteria infects bee larvae and results in chalkiness, which seriously harms beekeeping production. In this study, RNA-seq technique was used to analyze the differentially expressed genes of the host. In this study, A total of 191167730 (raw reads), fragments were obtained from RNA-seq of larval intestinal samples. 186284296 effective (clean reads), differentially expressed genes were obtained by filtration. The results of (DEG) analysis showed that the number of up-regulated and down-regulated genes was 4513 and 385. Gene ontology (GO) enrichment analysis, respectively, and the results showed that the number of up-regulated and down-regulated genes was 4513 and 385. Gene ontology (GO) enrichment analysis, respectively. The up-regulated gene enrichment in 45 GO entries (term), enrichment gene number is the most cell process, metabolic process and catalytic activity, down-regulated gene enrichment in 32 GO term, enrichment gene number is the most metabolic process. Single tissue process and catalytic activity. (pathway) enrichment analysis of KEGG metabolic pathway showed that up-regulated genes were enriched in 193 pathway,. The most abundant genes were ribosome, amino acid synthesis and carbon metabolism. The down-regulated genes were enriched in 59 pathway, and the most abundant genes were glycine, carbon metabolism and dicarboxylic acid metabolism. Further analysis showed that the cellular immunity of the host was significantly activated, and the Toll-like and Jak-STAT signaling pathways in humoral immunity were also activated by the balloon bacteria. The results provided important information for revealing the stress response mechanism of Chinese wasp larvae in the late stage of the Balloon invasion, and also laid a foundation for the analysis of the Balloon resistance mechanism of Chinese wasp larvae.
【作者單位】: 福建農(nóng)林大學(xué)蜂學(xué)學(xué)院;新疆維吾爾自治區(qū)蜂業(yè)技術(shù)管理總站;
【基金】:現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項資金(CARS-45-KXJ7) 福建農(nóng)林大學(xué)科技發(fā)展資金(KF2015123)
【分類號】:S895

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本文編號:2291785

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