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雞蛔蟲線粒體cox1和nad4基因的遺傳變異分析

發(fā)布時間:2018-10-20 11:43
【摘要】:為探究雞蛔蟲的種內(nèi)遺傳變異和系統(tǒng)發(fā)育關系,對分離自四川省西昌市的15個雞蛔蟲分離株的線粒體細胞色素c氧化酶第Ⅰ亞基(cox1)基因部分序列和煙酰胺腺嘌呤二核苷酸脫氫酶亞單位Ⅳ(nad4)基因全序列進行PCR擴增、序列測定及分析,并用cox1和nad4基因部分序列構建雞蛔蟲與其他蛔蟲的NJ樹和貝葉斯樹。測序結果顯示,所獲得的雞蛔蟲cox1和nad4基因全序列長度分別為1 152和1 236bp,分別有33和40個變異位點,堿基變異率分別為0~2.1%和0~2.3%;分別檢測到8和11個單倍型,總的單倍型多樣性分別為0.733±0.124和0.933±0.054,核苷酸多樣性分別為0.00433±0.00153和0.00541±0.00157,平均遺傳距離分別為0.004和0.005。構建的種系發(fā)育樹均顯示15個雞蛔蟲西昌分離株與其他國家/地區(qū)的雞蛔蟲分離株聚類形成一個分支,與鴿蛔蟲的親緣關系最近,與其他蛔蟲所屬的分支相隔較遠。研究結果表明雞蛔蟲西昌分離株的遺傳變異程度低,且nad4基因比cox1基因更適合作為研究雞蛔蟲分離株遺傳變異的分子標記。
[Abstract]:In order to study the relationship between genetic variation and phylogeny of Ascaris lumbricoides, Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 鈪,

本文編號:2283067

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