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黃牡丹PlWDR3和PlWDR18轉(zhuǎn)錄因子基因的克隆與表達

發(fā)布時間:2018-10-13 15:21
【摘要】:以云南野生黃牡丹為試驗材料,根據(jù)已構(gòu)建的云南野生黃牡丹花瓣轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫提供的WDR40蛋白的Unigene篩選得到19個與花色素合成相關(guān)的WDR40蛋白同源性高的Unigene序列,命名為PlWDR1~19.通過氨基酸序列比較和系統(tǒng)進化樹分析,發(fā)現(xiàn)PlWDR3和PlWDR18可能參與調(diào)控黃牡丹的花色素合成。PlWDR3的ORF包含1個1 032bp的開放閱讀框,編碼1個344個氨基酸的蛋白,與蘋果MdTTG1的親緣關(guān)系最近,相似性達83.29%;PlWDR18的ORF包含1個1 035bp的開放閱讀框,編碼1個345個氨基酸的蛋白,與葡萄VvWDR2相似性最高,達93.77%。相對熒光定量PCR分析表明,PlWDR3在黃牡丹和紫牡丹的不同時期的表達模式基本相似,在黃牡丹和紫牡丹圓桃期表達量最高,在初開期表達量最低;PlWDR18在黃牡丹花發(fā)育初期呈上升趨勢,在透色期達到最高峰,然后下降,在初開期達到最小值;在紫牡丹花發(fā)育初期亦呈上升趨勢,在圓桃期達到最大值,然后逐漸下降,在盛開期降到最小值。PlWDR18在黃牡丹和紫牡丹花的各個發(fā)育時期的表達量均高于PlWDR3的表達量。推測PlWDR3和PlWDR18參與黃牡丹花色形成的調(diào)控,為今后深入探討黃牡丹花色形成機制奠定基礎(chǔ)。
[Abstract]:Using Yunnan wild yellow peony as experimental material, 19 Unigene sequences with high homology of WDR40 protein related to anthocyanin synthesis were obtained according to the Unigene screening of WDR40 protein provided by the established transcriptional database of petals of Yunnan wild yellow peony, and named PlWDR1~19.. By amino acid sequence comparison and phylogenetic tree analysis, it was found that PlWDR3 and PlWDR18 may be involved in the regulation of anthocyanin synthesis in Peony. The ORF of PlWDR3 contains an open reading frame of 1 032bp and encodes a 344-amino acid protein. The ORF with the similarity of 83.29 and PlWDR18 contains an open reading frame of 1 035bp and encodes a protein of 1 345 amino acids, which is the most similar to the grape VvWDR2, reaching 93.77. Relative fluorescence quantitative PCR analysis showed that the expression patterns of PlWDR3 in different stages of yellow peony and purple peony were basically similar, the expression level of PlWDR3 was the highest in yellow peony and purple peony round peach, and the lowest in the initial opening stage, and PlWDR18 showed an upward trend in the early development of yellow peony. It reached the highest peak in the permeation period, then decreased, and reached the minimum value in the initial blooming stage, and increased in the early stage of the development of purple peony, reached the maximum value in the round peach stage, and then decreased gradually. The expression of PlWDR18 in yellow peony and purple peony was higher than that of PlWDR3. It was speculated that PlWDR3 and PlWDR18 were involved in the regulation of yellow peony color formation, which laid a foundation for further study on the mechanism of yellow peony color formation.
【作者單位】: 西北農(nóng)林科技大學風景園林藝術(shù)學院;中國林業(yè)科學研究院林業(yè)研究所國家林業(yè)局林木培育重點實驗室;
【基金】:國家“863”計劃(2011AA10020701) 西北農(nóng)林科技大學2015年博士科研啟動項目(Z109021611)
【分類號】:S685.11

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