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LRP6基因多態(tài)性與2型糖尿病易感性的關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時間:2018-10-04 18:43
【摘要】:目的探討低密度脂蛋白受體相關(guān)蛋白6(Low density lipoprotein receptor related protein 6,LRP6)基因多態(tài)性與2型糖尿病(Type 2 diabetes mellitus,T2DM)易感性的關(guān)聯(lián),并評價基因與環(huán)境因素的交互作用與T2DM發(fā)生的關(guān)系。方法本研究采用整群抽樣的方法,以自然村為基本單位,對“農(nóng)村糖尿病、肥胖及生活方式(RuralDiab)”研究中年齡18歲及以上的常住居民進(jìn)行問卷調(diào)查、體格檢查以及血樣標(biāo)本的采集,選取其中18-74歲的調(diào)查對象共計(jì)1998人納入本次分析。采用磁珠法抽提全血基因組DNA,采用Taqman熒光探針法對LRP6基因rs11054731和rs12823243位點(diǎn)進(jìn)行基因分型。分別采用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)和χ2檢驗(yàn)分析連續(xù)變量和分類變量在T2DM組和非T2DM組間的分布差異;運(yùn)用logistic回歸模型評估LRP6基因多態(tài)性與T2DM發(fā)病的優(yōu)勢比(Odds ratio,OR)和95%可信區(qū)間(Confidence interval,CI);運(yùn)用遺傳風(fēng)險評分對兩個位點(diǎn)的聯(lián)合作用進(jìn)行評價;根據(jù)受試者工作特征曲線下面積的改變和凈重新分類指數(shù)評價遺傳因素和環(huán)境因素對T2DM的判別效能,以上分析均采用SAS9.1軟件完成。運(yùn)用R軟件Haplo.stats數(shù)據(jù)包進(jìn)行單體型分析;基因與環(huán)境間的高階交互作用則運(yùn)用多因子降維模型進(jìn)行評價。結(jié)果研究對象共1998人,包括911名男性和1087名女性,T2DM組349人,非T2DM組1649人。1.性別、年齡、文化程度、職業(yè)、吸煙、飲酒、蔬菜水果攝入及體力活動在T2DM組和非T2DM組分布差異均具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。T2DM組腰圍、BMI、收縮壓、舒張壓、脈壓差、脈搏、總膽固醇、甘油三酯、低密度脂蛋白膽固醇和空腹血糖水平均高于非T2DM組;高密度脂蛋白膽固醇水平低于T2DM組,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.001)。2.LRP6基因rs11054731和rs12823243位點(diǎn)的基因型及等位基因分布頻率在T2DM組和非T2DM組中無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。調(diào)整協(xié)變量之前,rs11054731和rs12823243位點(diǎn)多態(tài)性和T2DM易感性之間未發(fā)現(xiàn)統(tǒng)計(jì)學(xué)關(guān)聯(lián)(P0.05)。調(diào)整性別、年齡、吸煙、飲酒、高脂飲食、蔬菜水果攝入、體力活動、T2DM家族史和BMI后,對于rs11054731位點(diǎn),攜帶AG基因型的人群發(fā)生T2DM的風(fēng)險是1.54(1.01-2.36)。3.單體型分析發(fā)現(xiàn),rs11054731和rs12823243位點(diǎn)GA、AT、AA、GT四種單體型在T2DM組和非T2DM組的頻率分布無差異,且和T2DM易感性無統(tǒng)計(jì)學(xué)關(guān)聯(lián)(P0.05)。未發(fā)現(xiàn)遺傳風(fēng)險評分與T2DM發(fā)生之間存在關(guān)聯(lián)。4.三種模型中,與僅考慮環(huán)境因素相比,納入遺傳因素后凈重新分類指數(shù)分別為3.06%、2.50%、0.79%,但對T2DM判別效能的改變不具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。rs11054731和rs12823243位點(diǎn)與環(huán)境因素在T2DM易感性中未發(fā)現(xiàn)交互作用。結(jié)論本研究人群中,LRP6基因rs11054731位點(diǎn)AG基因型能夠增加T2DM發(fā)病風(fēng)險。LRP6基因兩個位點(diǎn)的單體型和遺傳風(fēng)險評分與T2DM的易感性之間未發(fā)現(xiàn)存在關(guān)聯(lián)。LRP6基因與環(huán)境因素在T2DM的發(fā)生中未發(fā)現(xiàn)存在交互作用。
[Abstract]:Objective to investigate the association of low density lipoprotein receptor associated protein (6 (Low density lipoprotein receptor related protein 6) LRP6) polymorphism with susceptibility to type 2 diabetes mellitus (Type 2 diabetes mellitus,T2DM), and to evaluate the relationship between gene interaction with environmental factors and T2DM. Methods A cluster sampling method was used to investigate the residents aged 18 years and over in the study of "Rural Diabetes, Obesity and lifestyle (RuralDiab)", using natural villages as the basic unit. A total of 1998 subjects aged 18-74 were selected for physical examination and blood sample collection. The genomic DNA, of whole blood was extracted by magnetic bead method. The rs11054731 and rs12823243 loci of LRP6 gene were genotyped by Taqman fluorescence probe method. T test and 蠂 2 test were used to analyze the distribution difference between T2DM group and non T2DM group. Logistic regression model was used to evaluate the odds ratio (Odds ratio,OR) and 95% confidence interval (Confidence interval,CI) of LRP6 gene polymorphism to T2DM, and the combined effect of the two loci was evaluated by genetic risk score. According to the change of area under the operating characteristic curve and the net re-classification index, the discriminant effectiveness of genetic and environmental factors to T2DM was evaluated. The above analysis was completed by SAS9.1 software. The haplotype analysis is carried out with R software Haplo.stats packet, and the high-order interaction between gene and environment is evaluated by multi-factor dimensionality reduction model. Results A total of 1998 subjects, including 911 males and 1087 females, were enrolled in T2DM group (349 subjects) and non T2DM group (1649 subjects). Sex, age, education, occupation, smoking, drinking, vegetable and fruit intake and physical activity were significantly different in T2DM group and non-T2DM group (P0.05). T2DM group had significant differences in waist circumference, systolic blood pressure, diastolic blood pressure, pulse pressure, total cholesterol. The levels of triglyceride, low density lipoprotein cholesterol and fasting blood glucose were higher than those of non T2DM group, and the level of high density lipoprotein cholesterol was lower than that of T2DM group. The difference was statistically significant (P0.001) .2.There was no significant difference in genotype and allele distribution of rs11054731 and rs12823243 loci between T2DM group and non-T2DM group. There was no statistical association between rs11054731 and rs12823243 locus polymorphism and T2DM susceptibility before covariate adjustment (P0.05). After adjusting sex, age, smoking, alcohol consumption, high fat diet, vegetable and fruit intake, physical activity, family history of T2DM and BMI, the risk of T2DM for rs11054731 locus was 1.54 (1.01-2.36) .3. Haplotype analysis showed that there was no difference in frequency distribution between T2DM group and non-T2DM group, and there was no significant correlation between Rs11054731 and GA,AT,AA,GT in T2DM susceptibility (P0.05). No association between genetic risk score and T2DM was found. 4. 4. In the three models, compared with only environmental factors, the net re-classification index was 3.06 and 0.79, respectively, but there was no significant difference in the T2DM discriminant efficacy (P0.05) .rs11054731 and rs12823243 locus and environmental factors. No interaction was found in the susceptibility of T2DM. Conclusion the AG genotype at rs11054731 locus of LRP6 gene can increase the risk of T2DM. There is no association between haplotype and genetic risk score of two loci of LRP6 gene and susceptibility to T2DM. LRP6 gene and environmental factors are not found in T2DM. No interaction was found in the occurrence of the.
【學(xué)位授予單位】:鄭州大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:R587.1

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本文編號:2251464

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