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棉花適宜機采相關(guān)性狀的SSR標(biāo)記關(guān)聯(lián)分析及優(yōu)異等位基因挖掘

發(fā)布時間:2018-09-14 13:19
【摘要】:棉花機械采收對品種的生育期、株型及對脫葉劑敏感度有較高的要求。本研究利用覆蓋全基因組有多態(tài)性的214對SSR標(biāo)記對118份含有一個或多個機采性狀的種質(zhì)資源的株高、始節(jié)高、始節(jié)位、第一果枝平均長度、生育期及脫葉率6個機采相關(guān)性狀進行關(guān)聯(lián)分析。利用Structure 2.3.1軟件進行群體結(jié)構(gòu)分析,并結(jié)合2年2點12個重復(fù)的田間表型數(shù)據(jù),采用Tassel 5.0軟件的混合線性模型MLM關(guān)聯(lián)定位。結(jié)果檢測到460個等位基因,涉及905個基因型,基因多樣性指數(shù)平均為0.5151,PIC值平均為0.4587,基因多樣性指數(shù)和PIC值都大于平均數(shù)的標(biāo)記有99個,占總標(biāo)記數(shù)的46.3%,說明該批SSR標(biāo)記具有較多的等位變異數(shù)和較高的遺傳多樣性。群體結(jié)構(gòu)分析將118份供試材料劃分為4個亞群,結(jié)果顯示各類群中材料與地理來源無對應(yīng)關(guān)系。關(guān)聯(lián)分析結(jié)果顯示4種環(huán)境中,在顯著條件下(P0.05),共檢測到124個與6個機采相關(guān)性狀相關(guān)的位點,對表型變異解釋率范圍為2.23%~14.15%;其中在極顯著條件下(P0.01),共檢測到20個與機采相關(guān)性狀相關(guān)的位點,對表型變異解釋率范圍為4.84%~14.15%;诒狙芯康慕Y(jié)果,鑒定出典型的載體材料11份,分別為系7、金墾9號、Y11、豫棉18、AY-4、K2、朝陽棉2號、DZ22、中棉所43、C2和關(guān)農(nóng)長早B14。以上發(fā)掘出的控制棉花適宜機采性狀的優(yōu)異等位基因及優(yōu)異親本資源,可為機采棉的分子輔助選擇育種提供理論依據(jù)。
[Abstract]:Mechanical harvesting of cotton has high requirements for growth period, plant type and sensitivity to defoliant. In this study, 214 pairs of SSR markers covering the whole genome were used to study the plant height, initial node position and average length of the first fruit branch of 118 germplasm resources with one or more mechanically collected traits. Correlation analysis was carried out for 6 related characters of growth period and defoliation rate. The population structure was analyzed by Structure 2.3.1 software, and combined with 2 points and 12 repeated field phenotypic data for 2 years. The mixed linear model (MLM) of Tassel 5.0 was used to locate the population. Results 460 alleles were detected, involving 905 genotypes. The average genetic diversity index was 0.5151. The average PIC value was 0.4587. There were 99 markers whose genetic diversity index and PIC value were higher than the average. 46.3% of the total number of markers showed that the SSR markers had more allelic variances and higher genetic diversity. 118 tested materials were divided into 4 subgroups by population structure analysis. The results showed that there was no corresponding relationship between the materials and geographical sources. The results of correlation analysis showed that 124 loci related to 6 machine-picking related traits were detected under significant conditions (P0.05) in four environments. The interpretation rate of phenotypic variation was 2.23 and 14.15, among which 20 loci were detected under extremely significant conditions (P0.01), and the interpretation rate of phenotypic variation was 4.84% 14.15%. Based on the results of this study, 11 typical carrier materials were identified, which were line 7, Jinken 9, Y11, Yumian18AY-4K2, Chaoyang Mian2 DZ22, Zhongmiansuo 43C _ 2 and Guan Nongzao B14, respectively. The excellent alleles and parent resources to control cotton suitable for mechanical harvesting can provide theoretical basis for molecular assisted selection breeding of mechanically harvested cotton.
【作者單位】: 新疆農(nóng)墾科學(xué)院棉花研究所/農(nóng)業(yè)部西北內(nèi)陸區(qū)棉花生物學(xué)與遺傳育種重點實驗室;新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院;
【基金】:新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團博士資金項目(2013BB001);新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團重大科技項目(2016AA001-1) 國家自然科學(xué)基金項目(31260340)資助~~
【分類號】:S562

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本文編號:2242825

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