【摘要】：以LysM(PF01476)和Pkinase(PF00069)保守域全蛋白序列為種子序列,在全基因組范圍比對分析了蘋果(Malus×domestica Borkh.)LysM-RLK家族的成員,對其家族成員的理化性質、進化關系、染色體分布、基因結構等進行了分析;基于已公布的轉錄組學數(shù)據(jù),分析了LysM-RLK基因在蘋果組織、發(fā)育過程和生物脅迫中的表達情況。通過分析,共獲得12個蘋果LysM-RLK基因,其氨基酸序列大小介于553~1 053,分子量介于62.65~119.04 kD,等電點介于5.11~7.45,主要位于質膜;根據(jù)進化分析將其分為3個亞組,亞組內各成員的外顯子—內含子結構呈現(xiàn)較為相似的特征。基因表達數(shù)據(jù)顯示,蘋果的4個LysM-RLK基因表達存在較大的組織特異性,7個基因在蘋果腐爛病和再植病發(fā)病過程中為差異表達。
[Abstract]:Using LysM (PF01476) and Pkinase (PF00069) conserved whole protein sequences as seed sequences, the members of Malus 脳 domestica Borkh.) LysM-RLK family were analyzed in the whole genome range. The physicochemical properties, evolutionary relationship, chromosome distribution and gene structure of Malus 脳 domestica Borkh.) LysM-RLK family were analyzed. Based on the published transcriptome data, the expression of LysM-RLK gene in apple tissues, development process and biological stress was analyzed. A total of 12 LysM-RLK genes were obtained from apple, whose amino acid sequence size was between 553 and 1053, and the molecular weight was between 62.65 and 119.04 kD, isoelectric point, which was mainly located in the plasma membrane, and was divided into three subgroups according to evolutionary analysis. The exon-intron structure of each member of the subgroup showed similar characteristics. The data of gene expression showed that the four LysM-RLK genes in apple had higher tissue specificity and 7 genes were differentially expressed in the process of apple rot disease and replant disease.
【作者單位】： 甘肅農業(yè)大學園藝學院;
【基金】：甘肅省蘋果產業(yè)科技攻關項目(GPCK2013-2) 國家自然科學基金項目(31501728)
【分類號】：S661.1

【參考文獻】

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【二級參考文獻】

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本文編號：2238911