【摘要】：被稱為第三代測序技術(shù)的單分子測序是最近幾年發(fā)展起來的高通量測序技術(shù)。其中,由Pacbio Bio Sciences公司開發(fā)的單分子實(shí)時(shí)測序技術(shù)(SMRT)是最先商用的技術(shù)。SMRT測序技術(shù)通過對模板序列循環(huán)測序產(chǎn)生環(huán)形一致序列(CCS),成功克服第三代測序技術(shù)準(zhǔn)確率低的弊病。通過SMRT測序技術(shù),科學(xué)家可以更深入準(zhǔn)確地探究復(fù)雜環(huán)境微生物的結(jié)構(gòu)和功能。介紹SMRT測序技術(shù)在微生物16S rRNA基因測序中的優(yōu)勢和劣勢,并就基于SMRT測序技術(shù)所得的全長16S rRNA基因序列的質(zhì)量控制、錯(cuò)誤序列排除、聚類和注釋分析等重要分析環(huán)節(jié)進(jìn)行概述,同時(shí),提出利用SMRT測序技術(shù)研究復(fù)雜環(huán)境微生物可能存在的問題及其解決方法,期望能為研究人員提供參考。
[Abstract]:Single molecular sequencing, known as the third generation sequencing technology, is a high throughput sequencing technology developed in recent years. The monomolecular real-time sequencing technology (SMRT) developed by Pacbio Bio Sciences Company is the first commercial technology. SMRT sequencing technology successfully overcomes the disadvantage of low accuracy of the third generation sequencing technology by cyclic sequencing of template sequence to produce ring uniform sequence (CCS),. With SMRT sequencing, scientists can explore the structure and function of microbes in complex environments more accurately. This paper introduces the advantages and disadvantages of SMRT sequencing technology in microbial 16s rRNA gene sequencing, and summarizes the important analysis links such as quality control, error sequence elimination, clustering and annotation analysis of full-length 16s rRNA gene sequence obtained from SMRT sequencing technology. At the same time, the possible problems and solutions of using SMRT sequencing technology to study microbes in complex environment are put forward, which are expected to provide reference for researchers.
【作者單位】： 樂山職業(yè)技術(shù)學(xué)院;樂山豐野農(nóng)業(yè)科技有限責(zé)任公司;樂山市農(nóng)業(yè)局;
【基金】：樂山市科技局重點(diǎn)研究項(xiàng)目(16JSC128)
【分類號】：Q78

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前1條

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【共引文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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本文編號：2224835