【摘要】：為了研究泥蚶不同地理群體的遺傳多樣性和它們的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系,以采自來(lái)自7個(gè)地理群體的150個(gè)泥蚶個(gè)體為材料,對(duì)其線粒體細(xì)胞色素氧化酶亞基I(COI)的部分序列進(jìn)行PCR擴(kuò)增和序列比對(duì),分析泥蚶群體的遺傳多樣性;計(jì)算泥蚶不同地理群體間的遺傳距離及遺傳分化系數(shù),基于泥蚶群體平均遺傳距離構(gòu)建UPGMA聚類樹;以毛蚶Anadara sativa為外群,用MEGA6.0軟件中的ML法構(gòu)建了泥蚶單倍型之間的系統(tǒng)進(jìn)化樹以及用Network4.6軟件分析了所有單倍型的中介網(wǎng)絡(luò)圖。結(jié)果表明,泥蚶線粒體COI的基因片段的PCR產(chǎn)物大小約為509 bp。在目的序列片段中檢測(cè)到了14個(gè)多態(tài)性位點(diǎn),包括6個(gè)簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)和8個(gè)單變異多態(tài)性位點(diǎn),組成16個(gè)單倍型。群體中的核苷酸多態(tài)性和單倍型多態(tài)性均處于較低的水平,日本、海南、韓國(guó)三個(gè)群體的遺傳變異程度相對(duì)較高。7個(gè)群體間的遺傳距離在0.0002~0.0022之間,種群遺傳分化系數(shù)(FST)值在-0.01646~0.34422之間。通過(guò)構(gòu)建UPGMA聚類樹,發(fā)現(xiàn)廣西、江蘇、山東三個(gè)群體聚成一個(gè)小支,之后依次和浙江、海南、韓國(guó)、日本聚在一起,但總體而言泥蚶的不同地理群體之間并沒(méi)有形成明顯的遺傳分化。ML系統(tǒng)進(jìn)化樹和中介網(wǎng)絡(luò)圖表明在16個(gè)單倍型中,各單倍型之間未形成與其地理群體空間分布相對(duì)應(yīng)的聚類單元,也不存在明顯的進(jìn)化關(guān)系。
[Abstract]:In order to study the genetic diversity and phylogenetic relationship among different geographic populations, 150 individuals from 7 geographic groups were used as materials. The partial sequences of mitochondrial cytochrome oxidase subunit (I (COI) were amplified by PCR and compared with each other to analyze the genetic diversity of clams, and to calculate the genetic distance and genetic differentiation coefficient among different populations. The UPGMA clustering tree was constructed based on the average genetic distance of the population, the phylogenetic tree between haplotypes was constructed by ML method in MEGA6.0 software, and the network diagram of all haplotypes was analyzed by Network4.6 software. The results showed that the PCR product of mitochondrial COI was about 509 bp.. Fourteen polymorphic loci were detected in the target sequence, including 6 parsimonic information loci and 8 single mutation polymorphic loci, forming 16 haplotypes. The nucleotide polymorphism and haplotype polymorphism in the population were at a lower level, and the genetic variation was relatively high in Japan, Hainan and South Korea. The genetic distance between the seven populations was between 0.0002 and 0.0022. The genetic differentiation coefficient (FST) of the population was between -0.01646 and 0.34422. By constructing the UPGMA cluster tree, we find that Guangxi, Jiangsu and Shandong are grouped into a small branch, and then together with Zhejiang, Hainan, South Korea and Japan in turn. But in general, there was no significant genetic differentiation between different geographic populations of clams. ML phylogenetic tree and intermediary network showed that in 16 haplotypes, There is no cluster unit corresponding to the spatial distribution of the geographic population among the haplotypes, and there is no obvious evolutionary relationship between the haplotypes.
【作者單位】： 浙江省海洋水產(chǎn)養(yǎng)殖研究所;浙江省近岸水域生物資源開發(fā)與保護(hù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院海洋貝類工程技術(shù)研究中心;溫州醫(yī)科大學(xué)檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院;
【基金】：國(guó)家高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃(2012AA10A410-1) 浙江省重大科技專項(xiàng)(2012C12907-4) 浙江省科技計(jì)劃項(xiàng)目(2013F50016) 溫州市種子種苗科技創(chuàng)新專項(xiàng)(N20120017)
【分類號(hào)】：S917.4

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