丹參(Salvia miltiorrhize Bunge)是唇形科鼠尾草屬多年生藥用植物,具有活血通心、祛癖生新、涼血解癰等多種功效,臨床上廣泛用于多種疾病的預(yù)防與治療。丹參水溶性酚酸類物質(zhì)作為其主要的藥用成分,越來(lái)越受到研究者的關(guān)注。我們前期研究發(fā)現(xiàn),丹參R2R3-MYB類轉(zhuǎn)錄因子SmPAP1夠作為一個(gè)重要的調(diào)控蛋白參與調(diào)控酚酸類物質(zhì)的生物合成。目前關(guān)于SmPAP1的研究主要集中在其對(duì)下游靶基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控模式,但是作為一個(gè)重要的調(diào)控蛋白,有關(guān)其自身基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制的研究還未見報(bào)道,亟待補(bǔ)充。對(duì)SmPAP1啟動(dòng)子區(qū)保守DNA序列元件的分析結(jié)果顯示,在其啟動(dòng)子的不同區(qū)域內(nèi)存在多個(gè)潛在結(jié)合植物MYB類轉(zhuǎn)錄因子的順式作用元件,推測(cè)在丹參中SmPAP1可能作為一個(gè)正向調(diào)控蛋白結(jié)合于自身基因啟動(dòng)子從而激活自身基因表達(dá)。鑒于此,本研究采用由SmPAP1基因啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)GUS基因的報(bào)告載體,利用瞬時(shí)表達(dá)報(bào)告基因檢測(cè)法和葉盤轉(zhuǎn)化法分別在體外及體內(nèi)探究SmPAP1是否能夠激活其自身基因啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)錄活性。同時(shí),為進(jìn)一步分析轉(zhuǎn)錄因子SmPAP1在丹參次生代謝途徑中的潛在調(diào)控作用及分子作用機(jī)制,對(duì)丹參野生型及SmPAP1過(guò)表達(dá)植株進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及分析,探究在丹參中由SmPAP1過(guò)表達(dá)導(dǎo)致的差異表達(dá)基因可能行使的生物學(xué)功能及參與調(diào)控的生物學(xué)過(guò)程。本研究結(jié)果如下:1.利用根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)的瞬時(shí)表達(dá)技術(shù),將效應(yīng)載體35S::SmPAP1和報(bào)告載體SmPAP1-promoter::GUS在煙草表皮細(xì)胞中進(jìn)行共表達(dá),通過(guò)檢測(cè)報(bào)告基因的表達(dá)水平間接分析SmPAP1的過(guò)表達(dá)是否能夠激活其自身啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)錄活性。GUS組織化學(xué)染色和GUS蛋白活性檢測(cè)結(jié)果表明,SmPAP1的過(guò)表達(dá)能夠提高煙草細(xì)胞中GUS基因表達(dá)量及GUS蛋白活性,并且與對(duì)照組相比,其活性提高了5.15~15.50倍。說(shuō)明SmPAP1轉(zhuǎn)錄因子具有在胞內(nèi)對(duì)自身啟動(dòng)子進(jìn)行激活的能力。2.利用葉盤轉(zhuǎn)化法將表達(dá)載體SmPAP1-Promoter::GUS分別轉(zhuǎn)化到SmPAP1過(guò)表達(dá)、SmPAP1沉默及野生型丹參植株中,分析在丹參中SmPAP1表達(dá)量不同的情況下其自身啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)錄活性變化。經(jīng)PCR檢測(cè),分別獲得9個(gè)過(guò)表達(dá)陽(yáng)性株系(OE),16個(gè)沉默陽(yáng)性株系(ir)和7個(gè)野生型陽(yáng)性株系(C.K.)。實(shí)時(shí)定量PCR結(jié)果顯示:與對(duì)照組(C.K.)相比,過(guò)表達(dá)陽(yáng)性株系中GUS基因表達(dá)水平均表現(xiàn)出不同程度的升高,而沉默陽(yáng)性株系中GUS基因表達(dá)水平則顯著降低。GUS染色及GUS蛋白活性檢測(cè)結(jié)果表明,GUS基因表達(dá)量及GUS蛋白活性均與丹參中SmPAP1基因的表達(dá)量呈明顯正相關(guān):當(dāng)SmPAP1表達(dá)量升高時(shí),GUS染色加深且蛋白活性顯著升高,為對(duì)照組(C.K.)的1.43~2.13倍;相反當(dāng)SmPAP1表達(dá)量降低時(shí),GUS染色變淺且蛋白活性極顯著降低,為對(duì)照組的1.30%-2.99%。說(shuō)明在丹參中SmPAP1能夠直接或間接地激活其自身啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)錄活性。3.為進(jìn)一步明確轉(zhuǎn)錄因子SmPAP1對(duì)丹參次生代謝途徑的潛在調(diào)控作用,對(duì)丹參野生型及SmPAP1過(guò)表達(dá)株系進(jìn)行基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的差異基因篩選。結(jié)果顯示,與野生型植株相比,共有1,559條基因表達(dá)量發(fā)生顯著變化,其中566條基因表達(dá)量上調(diào),993條基因表達(dá)量下調(diào)。Gene Ontology功能顯著性富集分析結(jié)果顯示,差異基因共參與了69個(gè)GO ter m,即25個(gè)生物過(guò)程、38個(gè)分子功能以及6個(gè)細(xì)胞組成,較為顯著的GO分類有催化活性、響應(yīng)外界脅迫等。KEGG Pathway分析結(jié)果顯示,差異基因共參與了75條代謝途徑,顯著富集的途徑為9條,包括苯丙烷生物合成途徑、類黃酮生物合成途徑、二萜類生物合成途徑等。其中,次生代謝產(chǎn)物生物合成途徑中富集的差異基因數(shù)目最多,顯著性也最強(qiáng)。說(shuō)明,在丹參中過(guò)表達(dá)SmPAP1后,主要影響丹參次生代謝途徑。對(duì)差異基因進(jìn)一步分析結(jié)果表明,轉(zhuǎn)錄因子SmPAP1可能通過(guò)激活酪氨酸代謝途徑中TAT和苯丙烷代謝途徑中PAL基因的表達(dá),促進(jìn)酚酸類物質(zhì)的合成積累;同時(shí),SmPAP1基因的過(guò)量表達(dá)還降低了丹參酮類物質(zhì)合成途徑中關(guān)鍵酶基因CPS的轉(zhuǎn)錄水平。本研究通過(guò)體外及體內(nèi)實(shí)驗(yàn)探究了轉(zhuǎn)錄因子SmPAP1對(duì)其自身啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)錄激活作用。實(shí)驗(yàn)結(jié)果初步證明了在丹參中存在5SmPAP1基因的轉(zhuǎn)錄自激活調(diào)控。另外,SmPAP1基因參與了多條次生代謝途徑的調(diào)控,可能是通過(guò)調(diào)控PAL和TAT的表達(dá)影響丹酚酸類物質(zhì)合成。本研究為闡明SmPAP1轉(zhuǎn)錄因子的分子功能及調(diào)控機(jī)制提供一定的資料。
【學(xué)位授予單位】:陜西師范大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:Q943.2;S567.53
文章目錄
摘要
Abstract
第1章 文獻(xiàn)綜述
1.1 MYB類轉(zhuǎn)錄因子的概述
1.1.1 MYB類轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)與分類
1.1.2 R2R3-MYB類轉(zhuǎn)錄因子對(duì)植物的次生代謝的調(diào)控
1.2 丹參研究概況
1.2.1 丹參概況
1.2.2 丹參的主要活性成分及藥理作用
1.2.3 丹參酚酸類物質(zhì)生物合成途徑的研究概況
1.2.4 轉(zhuǎn)錄因子PAP1調(diào)控丹參酚酸類物質(zhì)生物合成途徑的調(diào)控
1.3 DNA與蛋白質(zhì)相互作用的研究
1.3.1 DNA與蛋白質(zhì)相互作用的研究方法
1.3.2 基于瞬時(shí)表達(dá)系統(tǒng)的DNA與蛋白質(zhì)相互作用的研究
1.4 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
1.4.1 轉(zhuǎn)錄組的概念
1.4.2 測(cè)序技術(shù)的發(fā)展
1.4.3 藥用植物轉(zhuǎn)錄組研究的意義
1.5 本研究的目的及意義
第2章 煙草中轉(zhuǎn)錄因子基因SmPAP1的轉(zhuǎn)錄自激活研究
2.1 實(shí)驗(yàn)材料、試劑及主要儀器
2.1.1 植物材料
2.1.2 菌株及載體
2.1.3 試劑與藥品
2.1.4 實(shí)驗(yàn)儀器
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 表達(dá)載體導(dǎo)入根癌農(nóng)桿菌GV3101
2.2.2 農(nóng)桿菌介導(dǎo)的煙草瞬時(shí)表達(dá)
2.2.3 GUS組織化學(xué)染色
2.2.4 GUS蛋白活性檢測(cè)
2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
2.3.1 煙草GUS組織化學(xué)染色結(jié)果
2.3.2 煙草GUS蛋白活性檢測(cè)結(jié)果
2.4 討論
第3章 丹參中轉(zhuǎn)錄因子基因SmPAP1的轉(zhuǎn)錄自激活研究
3.1 實(shí)驗(yàn)材料、試劑及主要儀器
3.1.1 植物材料
3.1.2 菌株
3.1.3 試劑與藥品
3.1.4 實(shí)驗(yàn)儀器
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 表達(dá)載體導(dǎo)入根癌農(nóng)桿菌EHA105
3.2.2 PCR鑒定根癌農(nóng)桿菌EHA105轉(zhuǎn)化子
3.2.3 根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)的葉盤轉(zhuǎn)化法轉(zhuǎn)化丹參
3.2.4 轉(zhuǎn)基因丹參株系的DNA水平檢測(cè)
3.2.5 轉(zhuǎn)基因丹參株系的RNA水平檢測(cè)
3.2.6 轉(zhuǎn)基因丹參株系的GUS組織化學(xué)染色
3.2.7 轉(zhuǎn)基因丹參株系的GUS蛋白活性檢測(cè)
3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
3.3.1 轉(zhuǎn)基因丹參株系DNA水平的檢測(cè)
3.3.2 轉(zhuǎn)基因丹參株系的GUS基因表達(dá)水平檢測(cè)
3.3.3 轉(zhuǎn)基因丹參株系GUS組織化學(xué)染色結(jié)果
3.3.4 轉(zhuǎn)基因丹參中GUS蛋白活性的定量檢測(cè)
3.4 討論
第4章 基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的差異表達(dá)基因分析
4.1 植物材料
4.2 實(shí)驗(yàn)方法
4.2.1 總RNA的提取
4.2.2 RNA測(cè)序
4.2.3 數(shù)據(jù)分析
4.2.4 轉(zhuǎn)錄組的差異表達(dá)分析
4.2.5 差異基因的富集分析
4.2.6 丹參SmPAP1過(guò)表達(dá)植株中次生代謝相關(guān)基因的差異表達(dá)分析
4.2.7 差異基因的實(shí)時(shí)定量PCR驗(yàn)證
4.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
4.3.1 測(cè)序產(chǎn)量統(tǒng)計(jì)
4.3.2 差異表達(dá)基因的篩選
4.3.3 Gene Ontology功能顯著性富集分析
4.3.4 KEGG Pathway顯著性富集分析
4.3.5 丹參次生代謝相關(guān)的差異表達(dá)基因
4.3.6 部分差異基因的實(shí)時(shí)定量PCR驗(yàn)證
4.4 討論
第5章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間研究成果
【參考文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):
2211563