【摘要】：目的比較單拷貝核基因、葉綠體基因及ITS等DNA條形碼在地黃屬的物種分辨率,探討地黃屬種間親緣關(guān)系。方法利用距離法與建樹法分析了地黃屬植物13個(gè)居群的12個(gè)單拷貝核基因、6個(gè)葉綠體基因以及ITS片段物種鑒定成功率,構(gòu)建了地黃屬系統(tǒng)發(fā)育樹。結(jié)果葉綠體matk和rbc L、單拷貝核基因物種分辨率普遍較低,多基因聯(lián)合分析有助于物種鑒定成功率的提高。在NJ樹中,地黃-茄葉地黃聚為一支,其他物種都是單系群,裂葉地黃位于系統(tǒng)發(fā)育樹基部。結(jié)論 ITS是地黃屬物種鑒定的核心條形碼,psb A-trnH、trnL-F、trnM-V、trnS-G可以作為備選方案,核基因RR255與R257可用作地黃專用鑒定條形碼。四倍體地黃起源方式有待進(jìn)一步澄清。
[Abstract]:Objective to compare the species resolution of single copy nuclear genes, chloroplast genes and ITS DNA barcodes in the genus Rehmannia, and to explore the relationship between species of Rehmannia. Methods A phylogenetic tree of the genus Rehmannia was constructed by using distance method and tree building method to analyze 12 single copy nuclear genes, 6 chloroplast genes and ITS fragments of 13 populations of Rehmannia. Results the species resolution of chloroplast matk and rbc L, single copy nuclear gene was generally low, and the combined analysis of polygenes was helpful to improve the success rate of species identification. In the NJ tree, Rehmannia glutinosa and Rehmannia solanica were clustered into one branch, and the other species were monophyletic groups, and Dihuang was located at the base of the phylogenetic tree. Conclusion ITS is the core bar code for species identification of Rehmannia. PSB A-trnHtrnL-FtrnM-VftrnS-G can be used as an alternative scheme, and nuclear genes RR255 and R257 can be used as specific bar codes for the identification of Rehmannia glutinosa. The origin of tetraploid Rehmannia glutinosa needs further clarification.
【作者單位】： 西北大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院西部資源生物與現(xiàn)代生物技術(shù)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31670219,31370353) 陜西省自然科學(xué)基礎(chǔ)研究計(jì)劃(2015JM3106) 陜西省教育廳項(xiàng)目(11JS093)
【分類號(hào)】：Q943.2

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本文編號(hào)：2207939