【摘要】：【目的】克隆甜高粱WRKY基因,分析其序列特征和表達譜,為甜高粱抗旱育種提供基因來源。【方法】以甜高粱品種M81-E幼苗總RNA為模板,利用RT-PCR技術(shù)克隆甜高粱WRKY基因,通過生物信息學(xué)軟件分析其序列特征,采用實時熒光定量PCR檢測基因表達情況,獲得2條WRKY基因,命名為SbWRKY1(Genebank登錄號:KY231904)和SbWRKY2(Genebank登錄號:KY231905)�！窘Y(jié)果】SbWRKY1 cDNA序列全長1086 bp,包括1個1059 bp的開放閱讀框,編碼352個氨基酸。SbWRKY2 cDNA序列全長750 bp,包括1個717 bp的開放閱讀框,編碼238個氨基酸。2個基因編碼的蛋白均具有WRKY核心序列"WRKYGQK"和"C-X4-5-C-X22-23-H-X1-H"鋅指結(jié)構(gòu)模型。SbWRKY1蛋白分子式為C_(1628)H_(2619)N_(509)O_(504)S_(16),預(yù)測蛋白質(zhì)分子量為37.89 kDa,等電點(PI)為9.78。SbWRKY2蛋白分子式為C_(1131)H_(1752)N_(326)O_(344)S_(21),預(yù)測蛋白質(zhì)分子量為26.09 kDa,等電點(PI)為8.43。系統(tǒng)進化樹分析表明,SbWRKY1蛋白與高粱、玉米和谷子WRKY蛋白親緣關(guān)系較近,SbWRKY2蛋白與高粱、芒草和玉米WRKY蛋白親緣關(guān)系較近。熒光定量PCR分析表明,隨著干旱脅迫時間延長,SbWRKY1和SbWRKY2呈上調(diào)表達趨勢�！窘Y(jié)論】SbWRKY1和SbWRKY2基因可能在甜高粱應(yīng)對干旱脅迫中發(fā)揮一定作用。
[Abstract]:[objective] to clone sweet sorghum WRKY gene, analyze its sequence characteristics and expression profile, and provide a gene source for drought resistance breeding of sweet sorghum. [methods] using total RNA of sweet sorghum variety M81-E as template, the WRKY gene of sweet sorghum was cloned by RT-PCR technique. The sequence characteristics were analyzed by bioinformatics software, and the expression of two WRKY genes was detected by real-time fluorescence quantitative PCR. Named SbWRKY1 (Genebank accession number: KY231904) and SbWRKY2 (Genebank accession number: KY231905). [results] the total length of SbWRKY1 cDNA sequence is 1086 BP, including an open reading frame of 1059 BP, encoding 352 amino acids, SbWRKY2 cDNA, 750bp in length, including 1 717bp open reading frame. The protein encoding 238 amino acids. The proteins encoded by two genes have WRKY core sequence "WRKYGQK" and "C-X4-5-C-X22-23-H-X1-H" zinc-finger structure model. The molecular formula of SbWRKY1 protein is C _ (1628) H _ (2619) N _ (509) O _ (504) S _ (16). The predicted molecular weight of protein is 37.89 kDa. the molecular formula of isoelectric point (PI) for 9.78.SbWRKY2 protein is C _ (1131) H _ (1752) N _ (326) O _ (344) S _ (21), and the predicted protein is C _ (1131) H _ (1752) N _ (344) S _ (21). The molecular weight is 26.09 kDa.The isoelectric point (PI) is 8.43. Phylogenetic tree analysis showed that SbWRKY1 protein was closely related to sorghum, maize and millet WRKY protein. SbWRKY2 protein was closely related to sorghum, mango and maize WRKY protein. Fluorescence quantitative PCR analysis showed that SbWRKY1 and SbWRKY2 were up-regulated with drought stress time. [conclusion] SbWRKY1 and SbWRKY2 genes may play a role in sweet sorghum response to drought stress.
【作者單位】： 中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院湛江實驗站廣東省旱作節(jié)水農(nóng)業(yè)工程技術(shù)研究中心;
【基金】：中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院湛江實驗站科研啟動專項資金項目(zjky201504);中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院基本科研業(yè)務(wù)費專項資金項目(17CXTD-07)
【分類號】：S566.5

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本文編號：2189897