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瘋草棘豆蠕孢菌吡咯啉5-羧化-還原酶基因敲除菌株的構(gòu)建

發(fā)布時(shí)間:2018-08-06 17:33
【摘要】:瘋草類植物廣泛分布于我國(guó)西部草原,動(dòng)物采食該類植物后會(huì)出現(xiàn)頭部水平震顫、運(yùn)動(dòng)障礙等典型的瘋草中毒癥狀,嚴(yán)重時(shí)可導(dǎo)致動(dòng)物死亡,給我國(guó)草原畜牧業(yè)造成巨大經(jīng)濟(jì)損失。研究表明,瘋草類植物的主要毒性成分是苦馬豆素(Swainsonine,SW),而瘋草棘豆蠕孢菌(Undifilum oxytropis)是瘋草內(nèi)苦馬豆素生物合成的根本原因。目前已知,苦馬豆素可由三類真菌產(chǎn)生,即豆類絲核菌(Rhizoctonia leguminicola)、金龜子綠僵菌(Metarhizium anisopliae)和瘋草棘豆蠕孢菌?囫R豆素的生物合成通路在豆類絲核菌和金龜子綠僵菌中研究已較為深入,而有關(guān)瘋草棘豆蠕孢菌苦馬豆素的生物合成通路及調(diào)控合成的關(guān)鍵酶尚不清楚。課題組前期采用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)瘋草棘豆蠕孢菌進(jìn)行了全基因組測(cè)序,通過(guò)基因功能和注釋分析并篩選出了可能的參與苦馬豆素生物合成的部分關(guān)鍵酶,而吡咯啉-5-羧化還原酶(pyrroline-5-carboxylate reductase,P5CR)就是其中一個(gè)關(guān)鍵的調(diào)控酶。鑒于此,本試驗(yàn)以瘋草棘豆蠕孢菌為研究對(duì)象,利用基因工程技術(shù)構(gòu)建瘋草棘豆蠕孢菌的P5CR基因敲除菌株,具體研究結(jié)果如下:1.根據(jù)瘋草棘豆蠕孢菌全基因組測(cè)序結(jié)果注釋的P5CR基因設(shè)計(jì)引物,以瘋草棘豆蠕孢菌cDNA為模板,高保真擴(kuò)增P5CR基因,PCR產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果與注釋的P5CR基因序列BLAST比對(duì)同源性為99%。2.以PUC19質(zhì)粒為載體,構(gòu)建了含潮霉素抗性基因的瘋草棘豆蠕孢菌P5CR基因的敲除載體,P5CR上游目的基因序列和下游目的基因序列分別連在潮霉素抗性基因的兩端。經(jīng)PCR驗(yàn)證、測(cè)序和雙酶切鑒定,成功構(gòu)建載體。3.將構(gòu)建好的載體質(zhì)粒線性化后,利用REMI轉(zhuǎn)化法將線性化載體轉(zhuǎn)化原生質(zhì)體,進(jìn)行瘋草棘豆蠕孢菌原生質(zhì)體P5CR基因的敲除。接著經(jīng)潮霉素篩選獲得轉(zhuǎn)化株,轉(zhuǎn)化株提取DNA,進(jìn)行PCR驗(yàn)證,結(jié)果顯示P5CR基因敲除菌株構(gòu)建成功。本研究成功獲得了瘋草棘豆蠕孢菌P5CR基因敲除菌株,為后續(xù)研究該基因?qū)Ο偛菁谷滏呔囫R豆素生物合成的影響及不產(chǎn)苦馬豆素瘋草新品種的培育奠定理論基礎(chǔ)。
[Abstract]:The wild grass plants are widely distributed in the western grassland of our country. After feeding on this kind of plants, the animals will appear the typical symptoms such as head level tremor, dyskinesia and so on, which can lead to the death of animals. To our country prairie animal husbandry causes the huge economic loss. The results showed that the main toxic component of the plants was Swainsonine SW, and (Undifilum oxytropis) was the root cause of the biosynthesis. Up to now, it has been known that kudousuin can be produced by three kinds of fungi, I. e., (Rhizoctonia leguminicola), mycelia, Metarhizium anisopliae (Metarhizium anisopliae), and C. spp. The biosynthesis pathway of kussinin has been studied deeply in Rhizoctonia legume and Metarhizium anisopliae, but the biosynthesis pathway and the key enzyme of controlling the biosynthesis are not clear. The whole genome was sequenced by high-throughput sequencing technique in the early stage of the study. Some key enzymes involved in the biosynthesis of koumarin were screened through gene function and annotation analysis. Pyrrolidine-5-carboxylation reductase (pyrroline-5-carboxylate reductase P5CR) is one of the key regulatory enzymes. In view of this, the P5CR gene knockout strain was constructed by genetic engineering. The results are as follows: 1. A primer was designed based on the P5CR gene annotated from the whole genome sequencing results of Echinococcus spp. The results of high-fidelity amplification of P5CR gene and BLAST sequence of the annotated P5CR gene showed that the homology was 99. 2. 2. Using PUC19 plasmid as vector, the knockout vector P5CR upstream target gene and downstream target gene sequence of P5CR gene containing hygromycin resistance gene were constructed and linked to the two ends of hygromycin resistance gene, respectively. The vector was successfully constructed by PCR, sequencing and double enzyme digestion. After the plasmid was linearized, the linearized vector was transformed into protoplast by REMI transformation method, and the P5CR gene of the protoplast was knockout. Then the transformed strain was screened by hygromycin, the transformed strain was extracted from the transformed strain, and the PCR was verified. The results showed that the P5CR gene knockout strain was successfully constructed. In this study, the P5CR gene knockout strain was successfully obtained, which laid a theoretical foundation for the further study of the effect of the gene on the biosynthesis of C. spp.
【學(xué)位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:Q93;Q78

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本文編號(hào):2168471

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