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海陵島近岸2種蝦虎魚線粒體COⅠ基因和D-loop區(qū)序列變異及遺傳分析

發(fā)布時(shí)間:2018-08-04 19:12
【摘要】:以海陵島近岸優(yōu)勢物種舟山韁蝦虎魚(Amoya chusanensis)、縱帶鸚蝦虎魚(Exyrias puntang)為研究對(duì)象,獲取2種蝦虎魚的線粒體COⅠ基因序列45條,控制區(qū)(D-loop)序列48條,分析其序列變異情況和遺傳特征。結(jié)果表明:獲得的638 bp COⅠ序列中,舟山韁蝦虎魚存在變異位點(diǎn)20個(gè),縱帶鸚蝦虎魚變異位點(diǎn)占18個(gè)。467 bp控制區(qū)中,舟山韁蝦虎魚變異位點(diǎn)10個(gè),縱帶鸚蝦虎魚占19個(gè)。堿基組成上,2種蝦虎魚COⅠ基因和控制區(qū)序列均存在A+T含量大于C+G含量現(xiàn)象,且COⅠ基因序列中堿基T偏向密碼子第一位。最大似然法估算的COⅠ序列轉(zhuǎn)換顛換R比值為2.89,控制區(qū)序列R值為2.66。聚類分析揭示舟山韁蝦虎魚在進(jìn)化上較原始,更接近祖先物種,而縱帶鸚蝦虎魚種群分化較晚。單倍型分析指明2種蝦虎魚單倍型多樣性均處在較高水平。中性檢驗(yàn)的Fu-Li D分析發(fā)現(xiàn),基于COⅠ基因和控制區(qū)序列的舟山韁蝦虎魚的檢驗(yàn)結(jié)果均顯著,不符合中性進(jìn)化假設(shè),縱帶鸚蝦虎魚Fu-Li D test的結(jié)果均呈現(xiàn)不顯著,符合中性進(jìn)化假設(shè)。舟山韁蝦虎魚種群間可能存在群體擴(kuò)張或持續(xù)增長現(xiàn)象。
[Abstract]:The (Amoya chusanensis), longitudinal band parrotfish (Exyrias puntang), a dominant species near the coast of Hailing Island, was used to obtain 45 mitochondrial CO 鈪,

本文編號(hào):2164871

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