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陸地棉GhMYB9基因克隆及結合特性分析

發(fā)布時間:2018-07-26 14:13
【摘要】:MYB轉錄因子蛋白普遍存在于植物中,廣泛參與植物的生長發(fā)育和代謝調控。為研究GhMYB9基因對棉纖維的調控機制,使用PCR方法,從棉花中克隆1個R2R3-MYB基因GhMYB9(Gen Bank登錄號:AF336286.1);利用生物信息學方法分析其氨基酸序列;構建酵母表達載體。結果表明,該基因c DNA全長1 145 bp,開放閱讀框長795 bp,編碼264個氨基酸,預測其蛋白分子量約為29.624 k D,等電點為9.13。推測的氨基酸序列中含有2個高度保守的SANT結構域。GhMYB9基因組包含2個外顯子和1個內含子。進化樹分析表明,GhMYB9和Gh MYB聚在同一分支(HQ234875.1)。酵母單雜交試驗結果表明,GhMYB9轉錄因子能夠特異結合AC順式作用元件。本研究結果為進一步闡明GhMYB9的生物學功能奠定了基礎。
[Abstract]:MYB transcription factor proteins are widely involved in plant growth and metabolism. In order to study the regulation mechanism of GhMYB9 gene on cotton fiber, a R2R3-MYB gene (GhMYB9 (Gen Bank accession number: AF336286.1) was cloned from cotton by PCR method, the amino acid sequence was analyzed by bioinformatics method, and yeast expression vector was constructed. The results showed that the full length of c DNA was 1 145 BP, the length of open reading frame was 795 BP, encoding 264 amino acids. The predicted molecular weight of c DNA was about 29.624 KD and the isoelectric point was 9.13. The deduced amino acid sequence contains two highly conserved SANT domains. GhMYB9 genome contains two exons and one intron. Phylogenetic tree analysis showed that GhMYB9 and Gh MYB were clustered in the same branch (HQ234875.1). Yeast single hybrid test showed that GhMYB9 transcription factor could specifically bind to AC cis-acting elements. The results of this study lay a foundation for further elucidating the biological function of GhMYB9.
【作者單位】: 新疆農(nóng)業(yè)大學農(nóng)學院/新疆農(nóng)業(yè)大學農(nóng)業(yè)生物技術重點實驗室;中國農(nóng)業(yè)科學院棉花研究所/棉花生物學國家重點實驗室;
【基金】:國家863項目(2012AA101108) 棉花生物學國家重點實驗室開放課題基金資助項目(CB2015A26) 國家自然基金項目(31260361;31560409)
【分類號】:S562

【相似文獻】

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本文編號:2146273

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