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棗實(shí)蠅氣味結(jié)合蛋白基因的克隆及表達(dá)譜分析

發(fā)布時間:2018-07-24 20:48
【摘要】:【目的】克隆棗實(shí)蠅Carpomya vesuviana Costa氣味結(jié)合蛋白(odorant binding protein,Cvco OBP)基因,對其表達(dá)譜進(jìn)行分析,為棗實(shí)蠅氣味結(jié)合蛋白的深入研究奠定基礎(chǔ)。【方法】對棗實(shí)蠅頭部RNA進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,通過蛋白序列比對以及構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹分析棗實(shí)蠅OBP序列,運(yùn)用半定量反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(semi-quantitative reverse transcription and polymerase chain reaction,sqRT-PCR)方法對獲得的Cvco OBP序列進(jìn)行組織表達(dá)特異性研究!窘Y(jié)果】轉(zhuǎn)錄組測序后共獲得7個OBP,命名為(Gen Bank登錄號分別為:KU975053、KU975054、KU975055、KX059394、KU975056、KX059395、KX059396)。對Cvco OBP1-7進(jìn)行蛋白序列比對發(fā)現(xiàn),Cvco OBP1、Cvco OBP3、Cvco OBP4、Cvco OBP6、Cvco OBP7是典型的OBP家族成員,具有6個高度保守的半胱氨酸殘基;Cvco OBP2和Cvco OBP5屬于"Minus-C"家族成員,具有4個高度保守的半胱氨酸殘基。系統(tǒng)進(jìn)化分析結(jié)果顯示,Cvco OBP1-7分別與不同的OBP有較近的進(jìn)化關(guān)系。半定量PCR檢測結(jié)果發(fā)現(xiàn),Cvco OBP1-7在棗實(shí)蠅腹部、頭部及胸部都有表達(dá),且表達(dá)量較高;Cvco OBP1、Cvco OBP2在翅中有表達(dá),但表達(dá)量相對較低;Cvco OBP1、Cvco OBP5、Cvco OBP6在足中也有表達(dá),但表達(dá)量相對較低!窘Y(jié)論】獲得并分析了7個Cvco OBP,不同Cvco OBP表達(dá)部位和表達(dá)量各不相同;Cvco OBP1-6分別屬于OBP56g,OBP8a,OBP83a,OBP56h,OBP99c,OBP83ef類型。
[Abstract]:[objective] to clone the Carpomya vesuviana Costa odor binding protein (odorant binding) OBP gene of jujube fly and analyze its expression profile, so as to lay a foundation for the further study of the odour binding protein. [methods] RNA in the head of jujube fruit fly was sequenced. OBP sequences of jujube fly were analyzed by protein sequence alignment and phylogenetic tree construction. Semi-quantitative reverse transcription and polymerase chain reaction-polymerase chain reaction (RT-PCR) was used to study the tissue expression specificity of the obtained Cvco OBP sequence. [results] Seven OBPs were obtained after transcriptome sequencing, named as (Gen Bank accession number KU975053, KU975054, KX059394KU975056, KX059395KX05939596). Protein sequence alignment of Cvco OBP1-7 revealed that Cvco OBP3Cvco OBP4Cvco OBP6Cvco OBP7 is a typical member of OBP family, with six highly conserved cysteine residues, Cvco OBP2 and Cvco OBP5 belonging to the "Minus-C" family, with four highly conserved cysteine residues. Phylogenetic analysis showed that Cvco OBP1-7 had a close evolutionary relationship with different OBP. The results of semi-quantitative PCR showed that Cvco OBP1-7 was expressed in the abdomen, head and chest of jujube fly, and Cvco OBP1Cvco OBP2 was expressed in the wings of the jujube fly, but the expression of Cvco OBP1, Cvco OBP5Cvco OBP6 was also found in the foot. But the expression level was relatively low. [conclusion] Seven Cvco OBPs were obtained and analyzed. The different Cvco OBP expression sites and expression levels were different. The OBP1-6 belonged to the OBP56gOBP8aOBP83hmh OBP99cOBP83ef type.
【作者單位】: 中國檢驗(yàn)檢疫科學(xué)研究院植物檢疫研究所;新疆出入境檢驗(yàn)檢疫局;中國農(nóng)業(yè)大學(xué);
【基金】:國家質(zhì)檢總局科研項(xiàng)目“重要檢疫性入侵害蟲棗實(shí)蠅監(jiān)測誘集物質(zhì)”(2015IK321) 國家“十二五”科技支撐計(jì)劃“重要外來有害生物傳入風(fēng)險及監(jiān)測技術(shù)”(2015BAD08B01) 質(zhì)檢公益性行業(yè)科研專項(xiàng)“外來生物定殖因子及危害因子研究及防控技術(shù)”(201410014)~~
【分類號】:S433

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級參考文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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本文編號:2142612

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