【摘要】：目的克隆燈盞花MYB基因的全長序列,為解析燈盞花MYB基因的功能奠定基礎(chǔ)。方法根據(jù)燈盞花轉(zhuǎn)錄組的相關(guān)信息,利用RACE方法從燈盞花中克隆到一個可能參與燈盞花乙素合成的MYB基因,在對其cDNA序列、核苷酸序列的相似性、理化性質(zhì)、疏水性、跨膜結(jié)構(gòu)、二級結(jié)構(gòu)及三級結(jié)構(gòu)進行分析預(yù)測的基礎(chǔ)上,對其進行多序列比對并構(gòu)建系統(tǒng)樹。同時,還構(gòu)建了該基因與綠色熒光蛋白的融合表達載體,并進行了初步轉(zhuǎn)化研究。結(jié)果克隆獲得燈盞花MYB基因,命名為ebMYB06,其開放閱讀框為783 bp,編碼260個氨基酸殘基,相對分子質(zhì)量為63 800,理論等電點(p I)為5.18,屬穩(wěn)定蛋白。其蛋白二級結(jié)構(gòu)主要由無規(guī)卷曲、α-螺旋和β-折疊構(gòu)成。根據(jù)燈盞花MYB與擬南芥MYB(AtMYB)的系統(tǒng)樹比對分析結(jié)果,發(fā)現(xiàn)ebMYB基因與擬南芥中的AtMYB4、7、32、6、8和AtMYB11、12、111 2亞群的基因聚類,推測所克隆基因在結(jié)構(gòu)或功能上,可能與這兩組具有共同性。實驗還表明所構(gòu)建的表達可用于燈盞花的高效轉(zhuǎn)化。結(jié)論首次從燈盞花中克隆到可能參與其苯丙烷代謝或環(huán)境響應(yīng)調(diào)控的MYB基因。
[Abstract]:Objective to clone the full-length sequence of MYB gene from Erigeron breviscapus and to lay a foundation for analyzing the function of MYB gene in Erigeron breviscapus. Methods according to the information of breviscapine transcriptome, a MYB gene was cloned from Erigeron breviscapus by RACE method. Its cDNA sequence, nucleotide sequence similarity, physicochemical properties and hydrophobicity were analyzed. Based on the analysis and prediction of the transmembrane structure, secondary structure and tertiary structure, the multi-sequence alignment is carried out and the system tree is constructed. At the same time, the fusion expression vector of the gene and green fluorescent protein was constructed, and the preliminary transformation was carried out. Results the MYB gene of Erigeron breviscapus was cloned and named ebMYB06.The open reading frame was 783 BP, encoding 260 amino acid residues. The relative molecular weight was 63 800 and the theoretical isoelectric point (p I) was 5.18, which was a stable protein. The protein secondary structure is mainly composed of random coil, 偽-helix and 尾-fold. According to the phylogenetic analysis of Erigeron breviscapus MYB and Arabidopsis MYB (AtMYB), it was found that the ebMYB gene was clustered with the subpopulations of AtMYB _ 4 and T _ MYB _ (11) ~ (121111) _ 2 in Arabidopsis thaliana. It was suggested that the cloned genes might share the same structure or function with these two groups. The results also showed that the constructed expression could be used for the efficient transformation of Erigeron breviscapus. Conclusion the MYB gene which may be involved in the regulation of phenylpropane metabolism or environmental response was cloned from Erigeron breviscapus for the first time.
【作者單位】： 云南師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;生物能源持續(xù)開發(fā)利用教育部工程中心;
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助項目(30660075,31360263) 云南省科技廳社會發(fā)展科技計劃基礎(chǔ)研究面上資助項目(2009CD052) 云南省基礎(chǔ)研究計劃資助項目(2011FA016)
【分類號】：S567.239

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本文編號：2141970