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白皮黃瓜鯊烯合酶基因cDNA克隆及生物信息學(xué)分析

發(fā)布時間:2018-07-18 16:02
【摘要】:為認(rèn)識葫蘆科植物中葫蘆素生物合成途徑所需鯊烯合酶基因結(jié)構(gòu)特征,克隆白皮黃瓜鯊烯合酶(squalene synthase,SS)基因c DNA并進行生物信息學(xué)分析。根據(jù)葫蘆科植物絞股藍、羅漢果、紅花栝樓等的鯊烯合酶基因cDNA序列,設(shè)計白皮黃瓜鯊烯合酶引物,分別采用3'RACE和5'RACE技術(shù)擴增鯊烯合酶基因3'端和5'端。獲得白皮黃瓜鯊烯合酶基因的兩個cDNA克隆,命名為CsSS1和CsSS2,其cDNA序列全長分別為1 627 bp和1 534 bp,都編碼417個氨基酸殘基,分子質(zhì)量為47.6 k D。成功克隆得到白皮黃瓜鯊烯合酶基因全長cDNA序列并對其進行序列分析,后續(xù)可用于葫蘆素生物合成途徑所需鯊烯合酶基因正選擇位點功能分析。
[Abstract]:In order to understand the structural characteristics of squalene synthase gene needed for cucurbitacin biosynthesis pathway in Cucurbitaceae, the squalene synthase (SS) gene was cloned and analyzed by bioinformatics. According to the cDNA sequences of squalene synthase genes of gynostemma pentaphyllum, Luohanguo and Trichosanthes kirilowii, the squalene synthase primers were designed. The squalene synthase 3 'and 5' end of squalene synthase gene were amplified by using 3 'race and 5' race techniques, respectively. Two cDNA clones of squalene synthase gene of Cucumber, CsSS1 and CsSS2, were obtained. The cDNA sequences were 1 627 BP and 1 534 BP, respectively, encoding 417 amino acid residues with molecular weight of 47.6 KD. The full-length cDNA sequence of squalene synthase gene was cloned and sequenced, which can be used to analyze the function of squalene synthase gene in cucurbitacin biosynthesis pathway.
【作者單位】: 廣西醫(yī)科大學(xué)生物化學(xué)與分子生物學(xué)教研室;廣西高校生物分子醫(yī)學(xué)研究重點實驗室;廣東醫(yī)學(xué)院藥學(xué)院;桂林醫(yī)學(xué)院;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(No.31260069) 廣西高等學(xué)?蒲许椖(No.201203YB038)共同資助
【分類號】:Q943.2

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本文編號:2132419

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