發(fā)布時間：2018-07-16 20:26

【摘要】：目的運用直接測序法和丙型肝炎病毒(HCV)基因分型試劑盒兩種方法,診斷HCV基因型并比對它們的結(jié)果,以評價HCV基因分型試劑盒的臨床使用效果。方法選取購買的2套商業(yè)HCV基因型血清盤和收集的45份HCV核糖核酸(RNA)陽性臨床樣本,用巢式聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)擴增HCV CORE區(qū)、NS5B區(qū),對擴增的序列進行測序以確定基因型別;再通過HCV基因分型試劑盒檢測樣本以確定基因型,對所得結(jié)果進行統(tǒng)計分析。結(jié)果 HCV NS5B區(qū)、CORE區(qū)檢測商業(yè)HCV基因型血清盤,分別檢測出16例(16/19)、15例(15/19);對于HCV基因分型試劑盒檢測中國常見的五種型別1b、2a、3a、3b、6a的樣本,HCV基因分型試劑盒的準(zhǔn)確性為7/7。45份HCV RNA陽性的臨床樣本中,所檢測出的基因型有1a(4份)、1b(6份)、2a(5份)、3a(5份)、3b(14份)、6a(7份)、6n(4份),測序法結(jié)果屬于五種亞型(1b、2a、3a、3b、6a)的有37份標(biāo)本,試劑盒檢測的結(jié)果與測序法一致的有29份,8份標(biāo)本未檢出,一致率為29/37。五種亞型以外的8份標(biāo)本,測序法與試劑盒檢測結(jié)果均不一致。結(jié)論通過此次對比結(jié)果可以看出,所用HCV基因分型試劑盒能夠準(zhǔn)確檢測出國內(nèi)常見的基因型,并且該方法操作簡便,檢測時間短,具有較大的臨床應(yīng)用價值。
[Abstract]:Objective to evaluate the clinical efficacy of HCV genotyping kit by using direct sequencing and HCV genotyping kit to diagnose HCV genotypes and compare their results. Methods the HCV core region was amplified by nested polymerase chain reaction (PCR) from two sets of commercial HCV genotypes and 45 HCV RNA positive clinical samples. The amplified sequences were sequenced to determine the genotypes. The genotypes were determined by HCV genotyping kit and the results were statistically analyzed. Results the commercial HCV genotypes were detected in the core region of HCV NS5B region. 16 cases (16 / 19) were detected and 15 cases (15 / 19) were detected respectively, and the accuracy of HCV genotyping kit was 7 / 7.45 clinical samples of HCV RNA positive for 5 common types of HCV genotyping kits in China, the accuracy of which was 7 / 7.45 clinical samples with HCV RNA positive, and the accuracy of HCV genotyping kit was 7 / 7.45 clinical samples which were positive for HCV RNA, and the accuracy of HCV genotyping kit was 7 / 7.45 clinical samples which were positive for HCV RNA. The genotypes were 1a (4), 1b (6), 2a (5), 3a (5), 3b (14), 6a (7), 6n (4). The results of sequencing and Kit were not consistent with 8 samples except five subtypes. Conclusion the results show that the HCV genotyping kit can accurately detect common genotypes in China, and this method is easy to operate, short detection time, and has great clinical application value.
【作者單位】： 中國疾病預(yù)防控制中心性病艾滋病預(yù)防控制中心參比室;
【分類號】：R512.63

【參考文獻】

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本文編號：2127579