【摘要】：目的:探討與永久性心房顫動(p AF)發(fā)生、發(fā)展相關的基因和信號通路,為研究p AF發(fā)生的分子機制提供基礎。方法:用Agilent 4x44K基因芯片分析p AF患者(n=7例)與竇性心律健康者(n=4例)的左心房組織m RNA,尋找差異表達的基因。以Gene Ontology(GO)和KEGG、Biocarta數(shù)據(jù)庫為基礎,分析差異表達基因參與的功能和信號通路。選取差異顯著的部分基因應用實時定量-聚合酶鏈式反應(q RT-PCR)在5例p AF患者與5例竇性心律健康者標本進行驗證。結果:表達譜結果顯示,共有987個差異表達基因,其中567個基因表達下調,420個基因表達上調。選取9個差異顯著的基因在新一組的病例標本上應用q RT-PCR驗證,結果顯示均有統(tǒng)計學差異,且改變與芯片結果一致。這些基因通過參與左心房組織纖維化、電重構、炎癥、細胞應激、代謝調節(jié)、轉錄調節(jié)等與p AF的發(fā)生密切相關。GO和Pathway分析表明下調的基因主要參與調節(jié)代謝,表達上調的基因影響細胞應激反應、免疫應答、血小板活化等過程。結論:通過基因芯片技術發(fā)現(xiàn)與p AF發(fā)生相關的重要基因,通過影響細胞代謝、炎癥、免疫應答、血栓形成等參與左心房的結構、功能重構。
[Abstract]:Aim: to explore the gene and signal pathways related to the occurrence and development of permanent atrial fibrillation (PAF), and to provide a basis for studying the molecular mechanism of PAF. Methods: Agilent 4x44K gene microarray was used to analyze the mRNAs in left atrium of 7 patients with Agilent and 4 healthy subjects with sinus rhythm, and the differentially expressed genes were found. On the basis of Gene Ontology (go) and KEGGfBiocarta database, the function and signaling pathway of differentially expressed genes were analyzed. Some genes with significant difference were selected for real-time quantification-polymerase chain reaction (Q RT-PCR) to be tested in 5 patients with pAF and 5 healthy controls. Results: the expression profile showed that there were 987 differentially expressed genes, 567 of which were down-regulated and 420 were up-regulated. Nine genes with significant difference were selected to be confirmed by Q RT-PCR in a new group of patients. The results showed that there were statistical differences and the changes were consistent with the results of microarray. These genes involved in left atrial fibrosis, electrical remodeling, inflammation, cellular stress, metabolic regulation, transcriptional regulation and so on were closely related to the occurrence of pAF. Go and Pathway analysis showed that down-regulated genes were mainly involved in regulating metabolism. The up-regulated genes affect cell stress response, immune response, platelet activation and so on. Conclusion: the important genes associated with the development of pAF were found by gene chip technique, and involved in the structural and functional remodeling of left atrium by influencing cell metabolism, inflammation, immune response and thrombosis.
【作者單位】： 首都醫(yī)科大學附屬北京朝陽醫(yī)院心外科;
【基金】：北京市教委科技面上項目(SQKM201410025018)
【分類號】：R541.75

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本文編號：2125341