本文選題：豬流行性腹瀉 + 山西分離株��； 參考：《中國獸醫(yī)雜志》2017年03期

【摘要】：為了研究山西地區(qū)豬流行性腹瀉病毒M基因的遺傳變異情況,從2014年10月~2015年4月山西地區(qū)11個(gè)地市收集的豬流行性腹瀉病毒(PEDV)病料中擴(kuò)增到4株P(guān)EDV的M基因,并進(jìn)行序列比對(duì)及遺傳分析。結(jié)果表明,4株P(guān)EDV的M基因與CV777毒株比較,部分核苷酸及氨基酸發(fā)生改變。4株P(guān)EDV的M基因核苷酸和氨基酸的同源性分別為99.6%~100%和99.1%~99.6%,與參考毒株的核苷酸和氨基酸的同源性分別為96.3%~99.9%和96.0%~99.1%。遺傳進(jìn)化分析顯示,4株P(guān)EDV與2010-2013年中國分離株(BJ2010、HB/BD、HB/FN、HLJ-2012、GDHZ-1202、SHQP/YM/2013)、2008年泰國KU04RB08株親緣關(guān)系較近;與2株泰國株(M_NIAH2013_95和M_NIAH1795_04)、2株歐洲株(CV777和Br1/87)和2006年中國分離株LZC親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。
[Abstract]:In order to study the genetic variation of porcine epidemic diarrhea virus (PEDV) M gene in Shanxi, 4 strains of PEDV M gene were amplified from porcine epidemic diarrhea virus (PEDV) collected from 11 cities in Shanxi from October 2014 to April 2015. Sequence alignment and genetic analysis were carried out. The results showed that the M gene of PEDV was compared with that of CV777 strain. The nucleotide and amino acid homology of M gene of PEDV was 99.6% and 99.6%, respectively. The homology of M gene with reference strain was 96.399% and 96.0% 99.1, respectively. Genetic evolution analysis showed that four PEDV strains were closely related to Chinese isolates from 2010 to 2013 (BJ2010 / HB-BDHBP / FNN / HLJ-2012GDHZ-1202HHZ-1202HQP- / YM / 2013), and to two Thai strains (MNIAH201395 and MNIAH179504) and two European strains (CV777 and Br187) to Chinese isolate LZC in 2006.
【作者單位】： 山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所;
【基金】：山西省科技攻關(guān)項(xiàng)目(20140311020-2-A);山西省科技攻關(guān)項(xiàng)目(20150311018-3)
【分類號(hào)】：S852.651

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本文編號(hào)：2105041