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閩西地區(qū)新流行豬偽狂犬病病毒gD基因分子特征

發(fā)布時(shí)間:2018-07-07 09:19

  本文選題:豬偽狂犬病病毒 + gD基因; 參考:《中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào)》2017年05期


【摘要】:本研究收集閩西不同地區(qū)的17株豬偽狂犬病病毒(PRV)分離株,并對(duì)其gD基因進(jìn)行遺傳變異分析,探討2013—2015年閩西地區(qū)PRV流行株的現(xiàn)狀、分子生物學(xué)特征和遺傳演化規(guī)律。結(jié)果顯示,17株P(guān)RV分離株與7株P(guān)RV國(guó)內(nèi)分離株核苷酸及氨基酸序列的同源性較高均為99.0%~100.0%;與4株國(guó)外PRV經(jīng)典株的核苷酸及氨基酸序列同源性相對(duì)較低,分別為98.6%~99.3%,97.0%~99.0%。核苷酸多序列比對(duì)結(jié)果顯示,17株P(guān)RV分離株最具有特征性的變化是在831~836bp插入了連續(xù)的6個(gè)堿基CCGGCC,進(jìn)而導(dǎo)致gD氨基酸序列275~276位增加了2個(gè)氨基酸RP?乖苑治鼋Y(jié)果顯示,這2個(gè)氨基酸還位于gD蛋白的抗原表位區(qū)內(nèi)。遺傳進(jìn)化樹分析結(jié)果顯示,17株P(guān)RV分離株與7株國(guó)內(nèi)分離株、韓國(guó)Yangsan株及美國(guó)Becker株位于一個(gè)相對(duì)獨(dú)立的遺傳分支內(nèi),親緣關(guān)系較近;與Bartha及Kaplan 2株匈牙利分離株位于不同的大遺傳進(jìn)化分支中,親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。
[Abstract]:In this study, 17 strains of porcine pseudorabies virus (PRV) isolated from different regions of western Fujian were collected and their GD gene genetic variation was analyzed. The present situation, molecular biological characteristics and genetic evolution of PRV epidemic strains in Western Fujian from 2013 to 2015 were discussed. The results showed that the homology of nucleotide and amino acid sequences between 17 PRV isolates and 7 domestic PRV isolates was 99.0100.00.The nucleotide and amino acid sequence homology was relatively low with four foreign PRV classical strains (98.6R 99.397.0) and 99.0% (P < 0.05), respectively. The results showed that the nucleotide sequence and amino acid sequence homology of 17 PRV isolates and 7 domestic PRV isolates were 99.0% and 99.0%, respectively. The results of nucleotide multiple sequence alignment showed that the most characteristic change of 17 strains was the insertion of 6 consecutive bases into the 831~836bp, which resulted in the addition of 2 amino acids to the amino acid sequence 275 ~ 276. The results of antigenicity analysis showed that the two amino acids were also located in the epitope region of GD protein. Phylogenetic tree analysis showed that 17 PRV isolates were closely related to 7 domestic isolates, Yangsan strain in Korea and Becker strain in the United States were located in a relatively independent genetic branch. The two Hungarian isolates, Bartha and Kaplan, were located in different branches of genetic evolution, and were closely related to each other.
【作者單位】: 龍巖學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院;福建省生豬疫病防控工程技術(shù)研究中心;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金青年科學(xué)基金資助項(xiàng)目(31602048) 福建省農(nóng)業(yè)科技重大專項(xiàng)基金資助項(xiàng)目(2014NZ0002-3) 福建省科技廳自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(2016J01712) 龍巖學(xué)院產(chǎn)學(xué)研合作資助項(xiàng)目(LC2015010)
【分類號(hào)】:S852.651

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本文編號(hào):2104511

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