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南蛇藤假種皮形成過(guò)程中萜類合成基因的表達(dá)分析

發(fā)布時(shí)間:2018-07-04 15:11

  本文選題:南蛇藤 + 萜類合成 ; 參考:《植物科學(xué)學(xué)報(bào)》2017年02期


【摘要】:為探究南蛇藤(Celastrus orbiculatus Thunb.)假種皮發(fā)育過(guò)程中萜類物質(zhì)合成相關(guān)基因的表達(dá)差異,本文選取3個(gè)不同發(fā)育時(shí)期(盛花期、落花期和幼果期)的南蛇藤雌花為實(shí)驗(yàn)材料,構(gòu)建3個(gè)c DNA文庫(kù),通過(guò)Illumina Hi SeqTM2000平臺(tái)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,共獲得87 600個(gè)unigene序列,平均長(zhǎng)度為453 bp,N50/N90比值為4.64。通過(guò)3個(gè)不同發(fā)育階段基因差異表達(dá)的比較及功能富集分析,鑒定出16個(gè)萜類合成相關(guān)基因,其中8個(gè)基因的編碼蛋白參與調(diào)控7個(gè)萜類合成代謝位點(diǎn)。還確定了與萜類合成相關(guān)的7個(gè)轉(zhuǎn)錄因子家族的成員數(shù)量以及相對(duì)表達(dá)量最高的基因。
[Abstract]:In order to study Celastrus orbiculatus Thunb. The expression of genes related to the synthesis of terpenoids was different during the development of the aril. Three cDNA libraries were constructed from female flowers of Sagitaria sinensis in three different developmental stages (full flowering, falling flower and young fruit). A total of 87,600 unigene sequences were obtained using Illumina Hi SeqTM2000 platform and the average length was 453bpN 50 / N 90 ratio of 4.64. By comparing the differentially expressed genes in three different developmental stages and analyzing their functional enrichment, 16 genes related to terpene synthesis were identified, of which 8 genes encoded proteins were involved in the regulation of 7 sites of terpene biosynthesis metabolism. The seven transcription factor families associated with terpene synthesis were identified as having the highest number of members and the highest relative expression levels.
【作者單位】: 北京林業(yè)大學(xué)自然保護(hù)區(qū)學(xué)院;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31370213) 北京市自然科學(xué)基金項(xiàng)目(5133036)~~
【分類號(hào)】:Q943.2;S567.19

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本文編號(hào):2096468

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