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藥用野生稻OoLEA1基因的克隆和生物信息學(xué)分析

發(fā)布時間:2018-07-03 11:15

  本文選題:水稻 + 藥用野生稻 ; 參考:《分子植物育種》2017年05期


【摘要】:藥用野生稻積累了豐富的遺傳多樣性和有利基因,是水稻遺傳改良的重要基礎(chǔ)資源。LEA蛋白在植物抗逆反應(yīng)起著重要的作用。本研究在藥用野生稻干旱脅迫差異轉(zhuǎn)錄譜數(shù)據(jù)分析基礎(chǔ)上,利用RT-PCR方法從藥用野生稻克隆了OoLEA1基因,OoLEA1的開放閱讀框長度為603 bp,編碼一個由200個氨基酸殘基組成的蛋白,分子量為20.73 k D,理論等電點(diǎn)為6.61。OoLEA1蛋白含有4個LEA_4結(jié)構(gòu)域、8個α-螺旋構(gòu)象和1個β-片層構(gòu)象,該蛋白為親水蛋白。OoLEA1受干旱和高溫誘導(dǎo)表達(dá),說明OoLEA1可能在水稻抗旱和抗高鹽脅迫中發(fā)揮作用。
[Abstract]:Medicinal wild rice has accumulated abundant genetic diversity and favorable genes, which is an important basic resource of rice genetic improvement. LEA protein plays an important role in plant stress resistance. In this study, based on the analysis of differential transcripts of drought stress in medicinal wild rice, the open reading frame length of OoLEA1 gene was 603 BP, encoding a protein composed of 200 amino acid residues, was cloned from medicinal wild rice by RT-PCR. The molecular weight is 20.73 KD, and the theoretical isoelectric point is 6.61. OoLEA1 protein contains four L EA4 domains, eight 偽 -helix conformation and one 尾 -lamellar conformation. The protein is a hydrophilic protein. OoLEA1 is induced by drought and high temperature. It suggested that OoLEA1 might play a role in drought resistance and high salt tolerance in rice.
【作者單位】: 華南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院;華南農(nóng)業(yè)大學(xué)公共基礎(chǔ)課實(shí)驗(yàn)教學(xué)中心;
【基金】:國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31271688) 華南農(nóng)業(yè)大學(xué)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃項(xiàng)目(201510564373)共同資助
【分類號】:Q943.2;S511.9

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本文編號:2093455

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