棉花GhMYB146基因克隆及亞細胞定位分析
本文選題:棉花 + GhMYB; 參考:《核農(nóng)學報》2016年11期
【摘要】:MYB轉(zhuǎn)錄因子是發(fā)育、代謝、生物和非生物脅迫應答調(diào)控網(wǎng)絡中的關鍵因子。為了分析棉花Gh MYB146轉(zhuǎn)錄因子的亞細胞定位,通過RT-PCR和RACE方法從棉花纖維中克隆了1個棉花MYB轉(zhuǎn)錄因子Gh MYB146的c DNA序列,采用生物信息學方法分析了Gh MYB146的氨基酸序列,構建了Gh MYB146基因的亞細胞定位載體并進行了亞細胞定位分析。結果表明,克隆的R2R3-MYB基因Gh MYB146的c DNA全長1 027 bp,開放閱讀框長879 bp,編碼292個氨基酸,蛋白質(zhì)預測分子量約為33.151 k D,等電點為7.9;推測的氨基酸序列中含有2個高度保守的SANT結構域;Gh MYB146基因組包含3個外顯子和2個內(nèi)含子。進化樹分析表明,Gh MYB146和Gh MYB5分為一個分支;亞細胞定位結果表明,Gh MYB146:GFP融合蛋白定位于細胞核中。本試驗結果為進一步研究Gh MYB146基因的生物學功能奠定了基礎。
[Abstract]:MYB transcription factors are key factors in developmental, metabolic, biological and abiotic stress response regulatory networks. In order to analyze the subcellular localization of cotton Gh MYB146 transcription factor, a cotton MYB transcription factor Gh MYB146 cDNA sequence was cloned from cotton fiber by RT-PCR and race, and the amino acid sequence of Gh MYB146 was analyzed by bioinformatics. The subcellular localization vector of Gh MYB146 gene was constructed and analyzed. The results showed that the cDNA of the cloned R2R3-MYB gene Gh MYB146 was 1 027 BP in length and 879 BP in open reading frame, encoding 292 amino acids. The predicted molecular weight of the protein is about 33.151 KD and the isoelectric point is 7.9. The deduced amino acid sequence contains two highly conserved SANT domain Gh MYB146 genome containing three exons and two introns. Phylogenetic tree analysis showed that Gh MYB146 and Gh MYB5 were divided into one branch, and subcellular localization showed that Gh MYB146: GFP fusion protein was located in the nucleus. The results laid a foundation for further study of the biological function of Gh MYB146 gene.
【作者單位】: 新疆農(nóng)業(yè)大學農(nóng)學院/新疆農(nóng)業(yè)大學農(nóng)業(yè)生物技術重點實驗室;中國農(nóng)業(yè)科學院棉花研究所/棉花生物學國家重點實驗室;
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1 曹雋U,
本文編號:2093096
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