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廣西地方稻種資源核心種質(zhì)紅色種皮全基因組關(guān)聯(lián)分析及鑒定兩個(gè)新的Rc等位基因

發(fā)布時(shí)間:2018-07-01 19:21

  本文選題:水稻 + 紅色種皮 ; 參考:《分子植物育種》2017年01期


【摘要】:稻米種皮顏色可以分為白、紅、黑等。在紅色稻米種皮中富含原花青素,其具有抗氧化活性,有利于人體健康。本研究以419份廣西地方稻種資源核心種質(zhì)為實(shí)驗(yàn)材料,利用全基因組關(guān)聯(lián)分析驗(yàn)證了控制水稻紅色種皮的基因Rc。利用In Del標(biāo)記HM1對97份紅色種皮材料的DNA進(jìn)行PCR,發(fā)現(xiàn)C323和C139屬于第7外顯子有14 bp缺失的紅色種皮品種。然后,我們利用Sanger測序技術(shù)對這兩個(gè)自然突變品種的Rc基因進(jìn)行外顯子測序,分析結(jié)果表明Rc ~(C139)和Rc ~(C323)屬于2種不同的Rc等位基因類型。
[Abstract]:Rice seed coat color can be divided into white, red, black and so on. The red rice seed coat is rich in proanthocyanidins and has antioxidant activity, which is beneficial to human health. In this study, 419 core germplasm of Guangxi local rice resources were used as experimental materials, and the gene Rc controlling the red seed coat of rice was verified by whole genome association analysis. In Del labeled HM1 was used for PCR-based DNA analysis of 97 red seed coat materials. It was found that C323 and C139 were red seed coat varieties with 14 BP deletion at exon 7. Then, we used Sanger sequencing technique to sequence the RC gene of these two natural mutants. The results showed that RC ~ (139) and RC ~ (C323) belonged to two different types of RC alleles.
【作者單位】: 廣西農(nóng)業(yè)科學(xué)院水稻研究所廣西水稻遺傳育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:廣西自然科學(xué)基金(2015GXNSFBA139080) 廣西科學(xué)計(jì)劃與研究項(xiàng)目(桂科AB16380117) 廣西農(nóng)業(yè)科學(xué)院優(yōu)勢團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目(2015YT15);廣西農(nóng)業(yè)科學(xué)院基本科研業(yè)務(wù)專項(xiàng)項(xiàng)目(桂農(nóng)科2016YM29;桂農(nóng)科2016JM09)共同資助
【分類號(hào)】:S511;Q943.2

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本文編號(hào):2088880

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