發(fā)布時(shí)間：2018-06-29 00:44

  本文選題：甘蔗 + CDK基因　； 參考：《作物學(xué)報(bào)》2017年01期

【摘要】：植物細(xì)胞周期依賴性蛋白激酶(cyclin-dependent kinases,CDKs)是一類絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶,與周期蛋白(Cyclins)協(xié)同作用,是重要的細(xì)胞周期性調(diào)控因子。本研究從甘蔗受花葉病毒侵染的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中獲得一條與高粱(Sorghum bicolor)CDK基因(Gen Bank登錄號(hào)為XP_002466536.1)高度同源的Unigene序列,通過RT-PCR擴(kuò)增獲得長度為1799 bp的甘蔗Sc CDK基因(Gen Bank登錄號(hào)為KR258796)。序列分析顯示Sc CDK基因含一個(gè)完整的開放閱讀框(65~1603 bp),編碼512個(gè)氨基酸,且具有CDK典型保守結(jié)構(gòu)域,如ATP結(jié)合位點(diǎn)、磷酸結(jié)合位點(diǎn)及活化環(huán)A-loop。此外,生物信息學(xué)預(yù)測顯示該基因編碼的蛋白定位于細(xì)胞核,為可溶性蛋白,不存在信號(hào)肽,二級結(jié)構(gòu)元件多為無規(guī)則卷曲,主要參與蛋白翻譯。實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析表明,Sc CDK基因的表達(dá)具有組織特異性,其在蔗芽上的表達(dá)量最高,其次是在蔗肉、蔗根、葉鞘和蔗皮中;在PEG、Na Cl和ABA的脅迫誘導(dǎo)過程中,Sc CDK均表現(xiàn)上調(diào)作用,且受ABA脅迫后表達(dá)量最高,約為對照組的1.9倍。推測該基因的表達(dá)與甘蔗抗干旱和抗?jié)B透脅迫有關(guān),同時(shí)受ABA的誘導(dǎo),參與細(xì)胞周期分裂。
[Abstract]:Plant cell cycle dependent protein kinases (cyclin-dependent kinases) are a kind of serine / threonine protein kinases, which interact with cyclins and are important cell cycle regulators. In this study, a highly homologous Unigene sequence of Sorghum bicolor CDK gene (GenBank accession number XP002466536.1) was obtained from the transcriptional database of sugarcane infected by Mosaic virus, and the length of SC CDK gene (GenBank accession number was KR258796) was obtained by RT-PCR amplification. Sequence analysis showed that Sc CDK gene contained a complete open reading frame (65m1603 bp), encoding 512 amino acids) and had typical conserved domains of CDK, such as ATP-binding sites, phosphoric acid binding sites and activation ring A-loops. In addition, bioinformatics prediction showed that the protein encoded by the gene was located in the nucleus and was soluble protein, and there was no signal peptide. The secondary structural elements were mostly irregular curl, mainly involved in protein translation. Real-time fluorescence quantitative PCR analysis showed that the expression of Sc CDK gene was tissue specific, and the highest expression was found in sugarcane bud, followed by sugarcane meat, root, leaf sheath and bark. During the stress induction of PEGN NaCl and ABA, Sc CDK was up-regulated, and the highest expression level was about 1.9 times as much as that of the control group under ABA stress. It is inferred that the expression of this gene is related to resistance to drought and osmotic stress in sugarcane and is induced by ABA to participate in cell cycle division.
【作者單位】： 福建農(nóng)林大學(xué)/農(nóng)業(yè)部福建甘蔗生物學(xué)與遺傳育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/國家甘蔗產(chǎn)業(yè)技術(shù)研發(fā)中心;
【基金】：福建省杰出青年科學(xué)基金(2015J06006) 福建省高等學(xué)校新世紀(jì)優(yōu)秀人才支持計(jì)劃(JA14095) 引進(jìn)國際先進(jìn)農(nóng)業(yè)科學(xué)技術(shù)計(jì)劃(948計(jì)劃)項(xiàng)目(2014-S18) 國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)(CARS-20)項(xiàng)目資助~~
【分類號(hào)】：S566.1

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本文編號(hào)：2080077