浙江省三個(gè)斑鱖野生群體線粒體DNA細(xì)胞色素b基因序列的遺傳變異
本文選題:斑鱖 + 細(xì)胞色素b基因; 參考:《浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào)》2017年10期
【摘要】:對(duì)錢塘江上游江山、烏溪江段和甌江上游云和段3個(gè)斑鱖(Siniperca scherzeri Steindachner)群體線粒體DNA細(xì)胞色素b(Cyt b)基因片段進(jìn)行了擴(kuò)增和測序,比較并分析了其遺傳多樣性和群體遺傳分化。結(jié)果顯示,在斑鱖Cytb基因965 bp的部分序列中,A+T含量(52.11%)略高于G+C含量(47.89%),77個(gè)個(gè)體中發(fā)現(xiàn)了16個(gè)多態(tài)性位點(diǎn),8種單倍型。江山群體、烏溪江群體和云和群體的單倍型多樣性分別為0.570±0.078、0.668±0.067、0.667±0.032,核苷酸多樣性分別為0.001 8±0.000 3、0.001 9±0.000 2、0.004 3±0.000 6。江山群體與烏溪江群體間的Fst為-0.005 16(P0.05),表明同為錢塘江上游的兩群體沒有明顯分化;但云和群體與江山群體、烏溪江群體間Fst分別為0.191 23(P0.01)和0.178 10(P0.01),表明甌江上游與錢塘江上游斑鱖群體存在顯著的分化。
[Abstract]:The mitochondrial cytochrome b (Cyt b) gene fragments of Siniperca scherzeri Steindachner in Jiangshan, Wuxi and Oujiang upper reaches of Qiantang River were amplified and sequenced. The genetic diversity and population differentiation of Siniperca scherzeri Steindachner were compared and analyzed. The results showed that the A T content (52.11%) in the 965 BP sequence of Cytb gene was slightly higher than that in G C (47.89%). Among 77 individuals, 8 haplotypes were found in 16 polymorphic loci. The haplotype diversity and nucleotide diversity of Jiangshan population, Wuxijiang population and Yunhe population were 0.570 鹵0.078 鹵0.067 鹵0.032 and 0.001 8 鹵0.000 3,0.001 9 鹵0.000 2 鹵0.004 3 鹵0.000 6, respectively. The Fst between Jiangshan population and Wuxi River population was -0.005 16 (P0.05), which indicated that there was no obvious differentiation between the two groups, but the Yunhe population and Jiangshan population did not differentiate obviously. The FST of the populations in Wuxi River was 0.191 (P0.01) and 0.178 10 (P0.01) respectively, which indicated that there was significant differentiation between the upper reaches of Oujiang River and the upper reaches of Qiantang River in Siniperca chuatsi (Siniperca chuatsi) populations.
【作者單位】: 浙江省水產(chǎn)技術(shù)推廣總站;
【基金】:2013年度浙江省農(nóng)業(yè)標(biāo)準(zhǔn)化研究項(xiàng)目“浙江省斑鱖種質(zhì)特性研究”
【分類號(hào)】:S917.4
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,本文編號(hào):2066966
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