本文選題：不明原因肺炎 + 腺病毒B組型　； 參考：《中國(guó)病原生物學(xué)雜志》2017年03期

【摘要】：目的對(duì)1例不明原因肺炎患者進(jìn)行病原學(xué)診斷,分析其病原學(xué)特征及重組特點(diǎn),為其防治提供參考。方法采集患者的咽拭子標(biāo)本,提取DNA,采用Real-time熒光定量PCR法檢測(cè)病原體特異性片段;采用Hep-2細(xì)胞培養(yǎng)分離病毒;通過(guò)Sanger測(cè)序hexon基因進(jìn)行型別鑒定,通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)病毒進(jìn)行全基因組測(cè)序,采用MEGA6.0軟件進(jìn)行序列比對(duì),通過(guò)鄰近歸并法(Neighbor-Joining)構(gòu)建種系發(fā)生進(jìn)化樹(shù)分析基因特征,運(yùn)用Simplot軟件進(jìn)行序列重組分析。結(jié)果從患者咽拭子標(biāo)本中檢測(cè)并分離到腺病毒,hexon基因測(cè)序后進(jìn)行比對(duì)分析,其與腺病毒B組55型及11型同源性較高;全基因測(cè)序顯示該病毒與HAdV-55QS-DLL及Shanxi/QZ01/2011株同源性較高,在E1B、DNA-Polymerase、100Ka Hexon和Fiber編碼區(qū)存在氨基酸變異;種系發(fā)生進(jìn)化樹(shù)顯示該毒株與腺病毒14型同屬一支,與腺病毒11型進(jìn)化分支較近;相似性曲線及BootScan分析顯示該病毒株于hexon編碼區(qū)存在HAdV-11與HAdV-14型間重組。結(jié)論本例患者不明原因肺炎由腺病毒B組55型感染引起,該病毒由HAdV-11與HAdV-14重組產(chǎn)生,其生物學(xué)特性有待進(jìn)一步研究。
[Abstract]:Objective to analyze the etiological characteristics and recombination characteristics of a patient with unknown pneumonia and to provide reference for its prevention and treatment. Methods the throat swabs of the patients were collected, DNA was extracted, real-time fluorescence quantitative PCR was used to detect the pathogen specific fragments, Hep-2 cells were cultured to isolate the virus, and the hexon gene was sequenced by Sanger. The whole genome of the virus was sequenced by high-throughput sequencing technique. The sequence alignment was carried out with MEGA 6.0 software. The phylogenetic tree was constructed by neighbor join method and the sequence recombination analysis was carried out with Simplot software. Results the adenovirus hexon gene was sequenced from the throat swabs of the patients, and compared with the adenovirus B group 55 and 11, the whole gene sequencing showed that the virus had high homology with HAdV-55QS-DLL and Shanxi-QZ01 / 2011 strain, and had higher homology with the adenovirus group B group 55 and 11, and the whole gene sequencing showed that the virus had high homology with HAdV-55QS-DLL and Shanxi-QZ01 / 2011 strain. There were amino acid variations in the coding region of 100Ka Hexon and fiber in E1BHN DNA-Polymerase, and the phylogenetic tree showed that the strain belonged to the same branch of adenovirus type 14, and was close to the evolutionary branch of adenovirus type 11. The similarity curve and BootScan analysis showed that there was a recombination between HAdV-11 and HAdV-14 in the hexon coding region. Conclusion the unknown pneumonia of this patient was caused by the infection of adenovirus group B 55, which was produced by the recombination of HAdV-11 and HAdV-14, and its biological characteristics need to be further studied.
【作者單位】： 衛(wèi)生部腸道病原微生物重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室江蘇省疾病預(yù)防控制中心;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.81501785) 江蘇省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.BK20141030) 江蘇省重大新發(fā)傳染病綜合防控科技示范工程項(xiàng)目(No.BE2015714)
【分類號(hào)】：R563.1

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 ;影響醫(yī)院治療后的肺炎患者長(zhǎng)期預(yù)后的因素[J];九江醫(yī)學(xué);1994年04期

2 邸亞新,陳瑞英,馮秀清,王永勝,郭青梅;老年肺炎患者血漿P物質(zhì)的測(cè)定[J];中華老年醫(yī)學(xué)雜志;2001年06期

3 楊萍,于泳,張蓬建,王連香;老年肺炎患者血清腫瘤壞死因子的測(cè)定及臨床意義[J];中國(guó)老年學(xué)雜志;2004年09期

4 李明友;黎永新;李亞紅;劉志蘭;莫建坤;雷達(dá);陳丹霞;;非典型肺炎患者免疫結(jié)果的分析[J];現(xiàn)代醫(yī)院;2005年12期

5 劉艷萍;廖建寧;孫如鸝;;58例高齡肺炎患者臨床分析[J];福建醫(yī)藥雜志;2006年04期

6 郭偉;張杰;楊中華;張維;;重癥肺炎患者的病原菌及臨床分析[J];北京醫(yī)學(xué);2007年04期

7 ;嚴(yán)重肺炎患者病愈后血炎性介質(zhì)高死亡危險(xiǎn)增加[J];現(xiàn)代醫(yī)院;2008年08期

8 夏敏杰;毛英媛;王福剛;;53例肺炎患者臨床療效觀察[J];中外醫(yī)療;2010年31期

9 楊慶斌;;高齡肺炎患者的臨床特點(diǎn)及救治體會(huì)[J];臨床肺科雜志;2010年12期

10 史紅霞;陳家芬;;1例肺炎患者血球分析中紅細(xì)胞結(jié)果異常分析報(bào)告[J];貴州醫(yī)藥;2010年07期

相關(guān)會(huì)議論文 前10條

1 黃捷暉;張艷;;社區(qū)獲得性耐甲氧西林金黃色葡萄球菌感染致重癥肺炎1例[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)急診醫(yī)學(xué)分會(huì)第十六次全國(guó)急診醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2013年

2 李建生;余學(xué)慶;李素云;孫子凱;張偉;鄭四平;賈新華;王海峰;王明航;;肺炎患者療效滿意度測(cè)評(píng)問(wèn)卷的考核[A];第十次全國(guó)中西醫(yī)結(jié)合防治呼吸系統(tǒng)疾病學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2009年

3 余學(xué)慶;李建生;李素云;孫子凱;張偉;鄭四平;施學(xué)忠;賈新華;王明航;王海峰;;基于療效評(píng)價(jià)的肺炎患者報(bào)告結(jié)局量表的考核[A];第十一次全國(guó)中西醫(yī)結(jié)合防治呼吸系統(tǒng)疾病學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2010年

4 李建生;余學(xué)慶;李素云;孫子凱;張偉;鄭四平;賈新華;王海峰;王明航;;肺炎患者療效滿意度測(cè)評(píng)問(wèn)卷的考核[A];全國(guó)中醫(yī)內(nèi)科肺系病第十四次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2010年

5 姚魁武;李建生;馬利軍;吳記珍;;老年人肺炎患者營(yíng)養(yǎng)狀況探討[A];第四次全國(guó)中西醫(yī)結(jié)合中青年學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2002年

6 劉建;黃芪;金常娥;劉曉晴;;老年肺炎患者免疫衰老機(jī)制的初步探討[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第七次全國(guó)呼吸病學(xué)術(shù)會(huì)議暨學(xué)習(xí)班論文匯編[C];2006年

7 吳翠芳;賈素潔;;1例肺炎患者出現(xiàn)精神癥狀的原因及抗菌藥物調(diào)整分析[A];第五屆臨床藥學(xué)實(shí)踐案例分析與合理用藥學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2012年

8 沈雁波;唐建中;黃中偉;莊燕;蔡丹磊;;重癥肺炎患者炎性細(xì)胞因子變化及應(yīng)用烏司他丁的影響[A];《中華急診醫(yī)學(xué)雜志社》第三屆組稿會(huì)暨急診醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)研討會(huì)論文匯編[C];2004年

9 成艷;牟蕓;高歡歡;蔣天安;;超聲斑點(diǎn)追蹤技術(shù)評(píng)價(jià)體外膜肺氧合治療的重癥肺炎患者的右心室局部功能[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第十三次全國(guó)超聲醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2013年

10 蔡莉娟;江榮林;;中西醫(yī)結(jié)合防治重癥肺炎患者胃腸功能衰竭的進(jìn)展[A];首屆全國(guó)中西醫(yī)結(jié)合重癥醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議暨中國(guó)中西醫(yī)結(jié)合學(xué)會(huì)重癥醫(yī)學(xué)專業(yè)委員會(huì)成立大會(huì)論文匯編[C];2010年

相關(guān)重要報(bào)紙文章 前2條

1 黃敏燕;左氧氟沙星可縮短肺炎患者住院時(shí)間[N];中國(guó)醫(yī)藥報(bào);2008年

2 北京大學(xué)醫(yī)史學(xué)研究中心 甄橙;肺炎大紀(jì)事[N];大眾科技報(bào);2003年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 王傳;保護(hù)性支氣管肺泡灌洗術(shù)與無(wú)菌吸痰在有創(chuàng)通氣重癥肺炎患者中病原學(xué)的比較研究[D];河北醫(yī)科大學(xué);2015年

2 劉君;重癥肺炎患者血泌乳素水平變化及其臨床意義[D];河北醫(yī)科大學(xué);2016年

3 徐建寧;重癥肺炎患者血嗜酸性粒細(xì)胞變化及其意義的臨床研究[D];浙江大學(xué);2010年

4 袁偉鋒;TNF-α基因單核苷酸多態(tài)性與肺炎的相關(guān)性研究[D];南方醫(yī)科大學(xué);2008年

5 周朕;老年肺炎患者外周血單個(gè)核細(xì)胞端粒酶活性變化[D];華中科技大學(xué);2006年

6 錢靖;不同年齡組重癥肺炎患者臨床特征分析[D];廣西醫(yī)科大學(xué);2015年

7 廖瑾莉;血清降鈣素原、腎上腺髓質(zhì)素與髓系細(xì)胞觸發(fā)受體-1在肺炎診斷與病情判斷上的價(jià)值[D];廣州醫(yī)學(xué)院;2009年

8 李偉文;60例重癥肺炎的臨床特征和預(yù)后相關(guān)因素分析[D];浙江大學(xué);2012年

9 章車明;重癥肺炎患者血清和肺泡灌洗液中IL-6和IL-10的動(dòng)態(tài)變化及其與預(yù)后的關(guān)系[D];蘇州大學(xué);2006年

10 彭博;肥胖對(duì)重癥甲型H1N1流感相關(guān)性肺炎預(yù)后的影響[D];吉林大學(xué);2011年

，

本文編號(hào)：2060746