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柳樹β微管蛋白基因家族的克隆和序列分析

發(fā)布時(shí)間:2018-06-21 03:26

  本文選題:柳樹 + β微管蛋白; 參考:《西北植物學(xué)報(bào)》2016年05期


【摘要】:該研究克隆鑒定了旱柳和龍爪柳β微管蛋白基因,并對其進(jìn)行了序列相似性、系統(tǒng)發(fā)育、染色體定位以及表達(dá)模式的分析。結(jié)果顯示,2種柳樹β微管蛋白基因家族各有20個(gè)成員,家族內(nèi)部成員間核酸和氨基酸序列相似性分別在74.0%和86.6%以上,種間同源蛋白氨基酸序列相似性在85.8%以上,柳樹與其它植物β微管蛋白間的氨基酸序列相似性在81.5%以上。系統(tǒng)發(fā)育分析顯示,柳樹β微管蛋白家族被分為4個(gè)亞組,結(jié)合楊樹β微管蛋白基因染色體定位,推測柳樹β微管蛋白基因家族經(jīng)歷了楊柳科全基因組重復(fù)事件和串聯(lián)重復(fù)事件,而柳樹TUB11和TUB12可能來源于區(qū)段重復(fù)或者轉(zhuǎn)座;虮磉_(dá)模式分析發(fā)現(xiàn),該家族成員的表達(dá)具有一定的組織特異性,并且部分重復(fù)基因?qū)υ谒鶛z測組織中表達(dá)差異較大。柳樹β微管蛋白基因家族成員序列的高度相似性、成員數(shù)量的進(jìn)化擴(kuò)張、以及表達(dá)模式的多樣性可能賦予了細(xì)胞分裂與生長更高的靈活性,這對多年生木本植物的生長發(fā)育習(xí)性意義重大。
[Abstract]:In this study, the 尾 tubulin genes were cloned and identified, and their sequence similarity, phylogeny, chromosome location and expression pattern were analyzed. The results showed that there were 20 members of 尾 -tubulin gene family in two species of willow, and the similarity of nucleic acid and amino acid sequence was 74.0% and 86.6%, respectively, and the amino acid sequence similarity of homologous protein among species was more than 85.8%. The amino acid sequence similarity of 尾 tubulin between willow and other plants was more than 81.5%. Phylogenetic analysis showed that the 尾 -tubulin family of willow was divided into four subgroups, which combined with chromosome localization of poplar 尾 -tubulin gene. It is inferred that the 尾 tubulin gene family of willow experienced the whole genome repeat event and tandem repeat event of willow, while TUB11 and TUB12 of willow probably originated from segment repeat or transposition. The analysis of gene expression pattern showed that the expression of the family members had a certain tissue specificity, and some of the repeated gene pairs expressed differently in the tested tissues. The high similarity of the family of 尾 -tubulin genes, the evolutionary expansion of the number of members, and the diversity of expression patterns may give cells greater flexibility in cell division and growth. This is of great significance to the growth and development habits of perennial woody plants.
【作者單位】: 國家林業(yè)局林木培育重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室中國林業(yè)科學(xué)研究院林業(yè)研究所;南京林業(yè)大學(xué)南方現(xiàn)代林業(yè)協(xié)同創(chuàng)新中心;
【基金】:國家自然科學(xué)基金青年項(xiàng)目(31400569)
【分類號】:S792.12

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級參考文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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本文編號:2046993

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