地被菊CVB病毒基因的RT-PCR檢測
本文選題:地被菊 + 菊花病毒。 參考:《植物保護學報》2016年06期
【摘要】:為建立可靠、靈敏且高效的地被菊中菊花B病毒(Chrysanthemum virus B,CVB)的檢測方法,利用特異性CVB基因引物,通過RT-PCR技術進行了特異性、重復性和靈敏度測試,最終利用優(yōu)化的RT-PCR體系對地被菊植株感染CVB病毒情況進行了檢測。結(jié)果顯示,以染病地被菊植株的總RNA為模板擴增出的特異性片段編碼211個氨基酸,與基因數(shù)據(jù)庫中其它來源的CVB基因外殼蛋白同源性為96%~99%,可確定為菊花B病毒外殼蛋白基因;重復性和靈敏度檢測中均獲得了清晰的目標條帶,且1 ng的總RNA即可擴增出特異性片段;對7個地被菊品種共32個植株的檢測中,CVB的檢出率為56.2%,檢測的準確率為68.75%。表明建立的地被菊CVB基因的RT-PCR檢測體系可有效用于地被菊植株感染病毒情況的鑒定。
[Abstract]:In order to establish a reliable, sensitive and efficient method for the detection of Chrysanthemum virus CVB in chrysanthemum, the specificity, reproducibility and sensitivity were tested by RT-PCR using specific CVB gene primers. Finally, the infection of CVB virus in ground cover chrysanthemum plants was detected by the optimized RT-PCR system. The results showed that the specific fragment amplified from the total RNA of infected chrysanthemum plants encode 211 amino acids, and the cover-protein homology of CVB gene from other sources in the gene database is 960.99%, which can be identified as the coat protein gene of chrysanthemum B virus. A clear target band was obtained in the detection of repeatability and sensitivity, and a specific fragment could be amplified with a total RNA of 1 ng, and the detection rate of CVB was 56.2% and the detection accuracy was 68.75% in 32 plants of 7 ground cover chrysanthemum cultivars. The results showed that the established RT-PCR detection system of CVB gene could be used to identify the virus infection in ground cover chrysanthemum plants.
【作者單位】: 東北林業(yè)大學生命科學學院;
【基金】:中央高校基本科研業(yè)務費(2572014CA21) 黑龍江省自然科學基金(C201343) 東北林業(yè)大學大學生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓練項目(201310225118)
【分類號】:S436.8
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本文編號:2045954
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