發(fā)布時(shí)間：2018-06-20 18:08

  本文選題：商陸 + 商陸皂苷甲��； 參考：《藥學(xué)學(xué)報(bào)》2017年09期

【摘要】：為研究商陸皂苷甲的生物合成途徑,利用Illumina Hi Seq 4000高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)商陸幼苗進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,得到9.60 Gb clean data,經(jīng)Trinity軟件組裝后獲得63 957條unigenes,平均長(zhǎng)度988.82 bp,其中24 517條unigenes(38.33%)能被Nr、Swiss-Prot、COG、KOG、Pfam、GO、KEGG等公共數(shù)據(jù)庫(kù)注釋。對(duì)注釋得到的unigenes進(jìn)行KEGG代謝通路分析,發(fā)現(xiàn)商陸轉(zhuǎn)錄組中有53個(gè)unigenes參與萜類骨架合成通路,有8個(gè)unigenes參與三萜合成通路,還有417個(gè)unigenes參與商陸其他次生代謝途徑。進(jìn)一步分析參與商陸皂苷甲生物合成后修飾酶相關(guān)基因,發(fā)現(xiàn)有130個(gè)unigenes可能具有CYP450的功能,參與商陸次生代謝產(chǎn)物的氧化/羥基化修飾;有46個(gè)unigenes與糖基轉(zhuǎn)移酶UGT相關(guān)。商陸轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的獲得為研究商陸皂苷甲和其他次生代謝產(chǎn)物的生物合成途徑奠定了基礎(chǔ),也為商陸藥材品質(zhì)的形成提供理論依據(jù)。
[Abstract]:In order to study the biosynthesis pathway of pokeweed saponin A, high throughput sequencing technique of Illumina Hi Seq 4000 was used to sequence the transcription sequence of pokeweed seedlings. After being assembled by Trinity software, we got 63,957 unigeneses, with an average length of 988.82 BP, of which 24,517 unigeneses (38.33) can be annotated by NrSwiss-ProtCOGGPfamKEGG and other public databases. KEGG metabolic pathway analysis showed that 53 unigenes were involved in terpenoid skeleton synthesis, 8 unigenes were involved in triterpenoid synthesis, and 417 unigenes were involved in other secondary pathways of pokeweed transcription. Further analysis of the genes involved in poke-saponin A biosynthesis enzyme showed that 130 unigenes may have CYP450 function and participate in the oxidative / hydroxylation modification of secondary metabolites of pokeweed, and 46 unigenes were related to glycosyltransferase UGT. The obtained data of pokeweed transcription set up the basis for studying the biosynthesis pathway of pokeweed saponin A and other secondary metabolites, and also provided the theoretical basis for the formation of the quality of pokeweed.
【作者單位】： 河南中醫(yī)藥大學(xué)藥學(xué)院;呼吸疾病診療與新藥研發(fā)河南省協(xié)同創(chuàng)新中心;
【基金】：中央引導(dǎo)地方科技發(fā)展專項(xiàng)(河南道地大宗藥材種質(zhì)評(píng)價(jià)及集約化種植與示范) 教育部科學(xué)技術(shù)研究重點(diǎn)資助項(xiàng)目:伏牛山中藥資源區(qū)系分析研究(DF2003078) 河南省科技攻關(guān)計(jì)劃資助項(xiàng)目(162102310468)
【分類號(hào)】：S567.239

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本文編號(hào)：2045218