本文選題：羊口瘡病毒 + FL基因�。� 參考：《西北農(nóng)業(yè)學報》2017年09期

【摘要】：旨在分析OrfV-CQ株F1L基因的分子特點,預測其編碼蛋白的生物學功能。對OrfV-CQ株F1L基因進行PCR擴增、克隆及序列測定,利用生物信息學相關(guān)軟件進行序列分析并對其編碼蛋白的二級結(jié)構(gòu)、B細胞表位、T細胞表位、保守結(jié)構(gòu)域、跨膜結(jié)構(gòu)域和信號肽進行預測。結(jié)果表明,OrfV-CQ株F1L基因長1 023bp,編碼340個氨基酸,與Shanxi株F1L基因的核苷酸和氨基酸同源性分別為98.4%和95.0%。OrfV-CQ株F1L基因編碼蛋白的α-螺旋、β-片層、β-轉(zhuǎn)角、無規(guī)則卷曲分別為11.21%、10.3%、2.73%、75.76%;可能存在5個B細胞優(yōu)勢抗原表位,3個CTL表位,4個Th細胞表位,無跨膜結(jié)構(gòu)域和信號肽。
[Abstract]:The aim of this study was to analyze the molecular characteristics of the F1L gene of OrfV-CQ strain and to predict its biological function. The F1L gene of OrfV-CQ strain was amplified by PCR, cloned, sequenced and sequenced by bioinformatics software. Transmembrane domain and signal peptide were predicted. The results showed that the length of F1L gene of OrfV-CQ strain was 1 023bpand encoding 340 amino acids. The nucleotide and amino acid homology of F1L gene of OrfV-CQ strain was 98.4% and 95.0%, respectively. The 偽 -helix, 尾 -lamellar, 尾 -rotation angle of F1L gene encoding protein of OrfV-CQ strain were 98.4% and 95.0%, respectively. The irregular curls were 11.21 / 10.3 and 2.730.75.76.The B cell epitopes, 3 CTL epitopes, 4 Th cell epitopes, no transmembrane domain and signal peptides may exist.
【作者單位】： 貴州大學動物科學學院;貴州省動物疫病研究所;
【基金】：貴州省科學技術(shù)基金[LH(2014)7667] 貴州省動物疫病防控與獸醫(yī)公共衛(wèi)生保障科技創(chuàng)新人才團隊[(2015)4016]~~
【分類號】：S852.65

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本文編號：2044408