冠突曲霉AN1類鋅指蛋白zfpA基因的克隆及表達(dá)分析
本文選題:茯磚茶 + 有性產(chǎn)孢; 參考:《基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)》2017年09期
【摘要】:本研究采用cDNA末端快速擴(kuò)增技術(shù)(rapid amplification of cDNA ends,RACE)克隆出冠突曲霉中zfpA基因的cDNA全長(zhǎng)序列并進(jìn)行生物信息分析。該序列全長(zhǎng)1 443 bp,開(kāi)放閱讀框長(zhǎng)度為924 bp,從312~1 235 bp,沒(méi)有內(nèi)含子序列。推測(cè)編碼的蛋白質(zhì)含有307個(gè)氨基酸,同源性分析顯示該基因與米曲霉的AN1鋅指蛋白(XP_001826567)相似性達(dá)71%。利用熒光定量PCR技術(shù)分析了zfpA基因在營(yíng)養(yǎng)菌絲體階段、無(wú)性產(chǎn)孢階段及有性產(chǎn)孢階段的表達(dá)量差異。結(jié)果表明,這個(gè)基因在在無(wú)性產(chǎn)孢時(shí)期的表達(dá)量最低,有性產(chǎn)孢時(shí)期的表達(dá)量最高,相比無(wú)性產(chǎn)孢時(shí)期上調(diào)了4倍。本實(shí)驗(yàn)為深入研究zfpA基因?qū)谕磺沟漠a(chǎn)孢調(diào)控機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:In this study, the full-length cDNA sequence of zfpA gene from Aspergillus coronatum was cloned by rapid amplification of cDNAs RACEE and the biological information was analyzed. The length of the sequence was 1 443 BP, the length of the open reading frame was 924 BP, and the length of the open reading frame was 1 235 BP from 312 to 1 235 BP, with no intron sequence. The deduced protein contained 307 amino acids. Homology analysis showed that the similarity between the gene and AN1 zinc finger protein XP001826567 of Aspergillus oryzae was 71%. The difference of zfpA gene expression in vegetative mycelia stage asexual sporulation stage and sexual sporulation stage was analyzed by fluorescence quantitative polymerase chain reaction (FQ-PCR). The results showed that the expression of this gene was the lowest in asexual sporulation stage and the highest in sexual sporulation stage, which was 4 times higher than that in asexual sporulation stage. This study laid a foundation for further study on the sporulation regulation mechanism of zfpA gene on Aspergillus coronatum.
【作者單位】: 貴州大學(xué)農(nóng)學(xué)院;貴州省生物技術(shù)研究所;貴州省農(nóng)業(yè)生物技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;貴州省農(nóng)業(yè)科學(xué)院;
【基金】:貴州省聯(lián)合基金(黔科合LH字(2014)7688號(hào)) 貴州省科技基礎(chǔ)條件平臺(tái)專項(xiàng)計(jì)劃(黔科平臺(tái)(2015)4007)基金共同資助
【分類號(hào)】:Q78;Q93
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,本文編號(hào):2036453
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