中華鱉tyrp-1基因的生物信息學(xué)分析
本文選題:中華鱉 + tyrp-基因; 參考:《河北大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版)》2017年03期
【摘要】:為闡明中華鱉酪氨酸酶相關(guān)蛋白1(TYRP-1)基因tyrp-1及蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與性質(zhì),利用相關(guān)軟件、數(shù)據(jù)庫(kù)和方法對(duì)其進(jìn)行了生物信息學(xué)分析.結(jié)果顯示,基因轉(zhuǎn)錄本全長(zhǎng)為2 829bp,編碼535個(gè)aa.預(yù)測(cè)TYRP-1蛋白分子質(zhì)量為60.16ku,理論等電點(diǎn)為5.35,為不穩(wěn)定蛋白;N端含有信號(hào)肽,與信號(hào)識(shí)別蛋白結(jié)合后,促進(jìn)其穿越內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔;C端含有跨膜結(jié)構(gòu)域,錨定于細(xì)胞膜上,發(fā)揮重要的生物學(xué)功能;TYRP-1蛋白含有2個(gè)銅離子結(jié)合結(jié)構(gòu)域,與DCT蛋白有明顯的相互作用.
[Abstract]:In order to elucidate the tyrp-1 and protein structure and properties of tyrosinase associated protein 1 (TYRP-1) gene in Trionyx sinensis, bioinformatics analysis was carried out by using relevant software, database and method. The results showed that the full length of the transcripts was 2 829 BP, encoding 535 aas. It was predicted that the molecular weight of TYRP-1 protein was 60.16kuand the theoretical isoelectric point was 5.35. It was suggested that the N-terminal of TYRP-1 protein contained signal peptide. After binding with signal recognition protein, TYRP-1 protein was promoted to cross the endoplasmic omentum into the endoplasmic reticulum cavity and the C-terminal contained transmembrane domain, which was anchored on the cell membrane. TYRP-1 protein, which plays an important biological function, contains two copper ion-binding domains and interacts with DCT protein.
【作者單位】: 河北大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;保定水產(chǎn)技術(shù)推廣站;
【基金】:河北省自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(C2016201207) 河北省現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系淡水養(yǎng)殖創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目
【分類號(hào)】:S917.4
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