芒果GGPPS基因的克隆與表達分析
發(fā)布時間:2018-06-08 13:24
本文選題:芒果 + GGPPS ; 參考:《分子植物育種》2017年01期
【摘要】:在植物中,異戊烯焦磷酸(GGPP)是赤霉素、胡蘿卜素、葉綠素等異戊二烯類化合物的公共前體物質(zhì)。從芒果栽培品種貴妃芒的新鮮葉片中提取DNA和RNA,根據(jù)轉(zhuǎn)錄組測序拼接結(jié)果設計引物擴增得到香葉基香葉基焦磷酸合成酶基因(Min GGPPS1)。通過測序、多重比對和聚類分析,證實該片段屬于GGPPS的全長基因并且為最大的ORF,全長為1 100 bp。與芒果Min GPS2(AFJ52722.1)氨基酸序列同源性為92%。蛋白質(zhì)序列分析表明該序列含有兩個DDx_(2-4)D保守基元(FARM和SARM)基元和一個Cxxx C基元。我們選取了擬南芥中12個GGPPS基因、2個FPPS基因、2個SPPS基因、一個GPS基因及其他物種的相關基因,通過聚類分析表明,Min GGPPS1屬于香葉基香葉基焦磷酸合成酶大亞基。表達分析表明:Min GGPPS1在葉片中表達量最高,莖部表達量最低,青果果皮和成熟果果皮中表達量相似,在成熟果肉中的表達量大約是青果果肉表達量的5倍,暗示Min GGPPS1具有調(diào)控果肉后熟的功能。
[Abstract]:in that plant , the isoamylene pyrophosphate ( GGPP ) is a common precursor substance of isoprenoid compounds such as gibberellin , carotene , chlorophyll and the like . DNA and RNA are extracted from fresh leaves of the mangoes of the mango cultivars , and primer amplification is design according to the sequencing splicing result of the transcriptome group to obtain the geranyl geranyl pyrophosphate synthetase gene ( Min GGPPS1 ) . The results showed that Min GGPPS1 contained two DDx _ ( 2 - 4 ) D conserved motifs ( FARM and SARM ) motifs and a Cxxx C motif . The results showed that Min GGPPS1 contained two DDx _ ( 2 - 4 ) D conserved motifs ( FARM and SARM ) motifs and a Cxxx C motif .
【作者單位】: 海南大學農(nóng)學院;中國熱帶農(nóng)業(yè)科學院熱帶作物品種資源研究所農(nóng)業(yè)部華南作物基因資源與種質(zhì)創(chuàng)制重點開發(fā)實驗室;
【基金】:中央級科研單位基本科研業(yè)務費(1630032013009;1630032014013)資助
【分類號】:S667.7;Q943.2
【相似文獻】
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1 李永梅;橡膠草GGPPS基因的克隆和功能分析[D];石河子大學;2016年
,本文編號:1995940
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