TRIM28對綿羊早期克隆胚胎印記基因甲基化作用的研究
本文選題:TRIM28 + DNA甲基化。 參考:《石河子大學(xué)》2016年碩士論文
【摘要】:目的:體細(xì)胞克隆動物因基因組重編程不完全,部分基因甲基化異常導(dǎo)致流產(chǎn)、死胎和巨嬰癥等諸多問題。TRIM28在植入前早期胚胎發(fā)育過程中對印記基因甲基化的維持起著重要作用,母源TRIM28缺失可導(dǎo)致正常受精胚胎死亡,其發(fā)育過程中具有與克隆異常胎兒相同的癥狀,而且母源合子轉(zhuǎn)換過程中TRIM28的表達量與印記基因DMR的甲基化水平密切相關(guān)。本研究通過分析過表達TRIM28細(xì)胞克隆的胚胎中與正常細(xì)胞克隆胚胎TRIM28表達和甲基化水平差異,探究TRIM28是否與綿羊早期克隆印記基因異常去甲基化有關(guān)。方法:實驗一:通過提取中國美利奴細(xì)毛羊卵巢組織RNA,反轉(zhuǎn)錄后獲得cDNA,設(shè)計特異性引物以擴增TRIM28基因編碼區(qū)序列,經(jīng)測序后采用生物信息學(xué)軟件對編碼區(qū)序列及氨基酸序列進行相關(guān)生物信息學(xué)分析和結(jié)構(gòu)預(yù)測,并采用RT-PCR對綿羊不同組織中TRIM28表達量進行檢測繪制組織表達圖譜和成纖維細(xì)胞中與其互作參與甲基化調(diào)控的基因進行了表達量的檢測。實驗二:構(gòu)建TRIM28真核表達載體及干擾si RNA,通過電轉(zhuǎn)染綿羊成纖維細(xì)胞篩選得到能夠高效表達的重組表達載體和有效抑制TRIM28,并檢測轉(zhuǎn)染后細(xì)胞TRIM28的表達量對DNA甲基化基因和印記基因表達表達水平的影響。實驗三:分別收集正常體細(xì)胞和過表達TRIM28體細(xì)胞核移植后不同發(fā)育時期克隆重構(gòu)胚胎,采用RT-q PCR檢測不同發(fā)育時期胚胎中TRIM28基因的m RNA表達量;收集2-cell和囊胚,提取基因組,重亞硫酸鹽處理后采用BSP法克隆印記基因H19和IGF2R的差異甲基化區(qū)域,檢測印記基因H19和IGF2R甲基化水平。結(jié)果:本研究克隆得到了綿羊TRIM28基因完整CDS序列,長度為2441 bp。獲得的該基因核苷酸序列及所編碼的氨基酸序列與人、牛、豬、小鼠等動物核苷酸序列和氨基酸序列具有非常高的一致性。TRIM28 m RNA在綿羊的心臟、肝臟、脾臟、肺臟、腎臟、肌肉、卵巢組織中均有表達,組織表達譜結(jié)果顯示,TRIM28 m RNA在中國美利奴細(xì)毛羊肺臟、脾臟和卵巢中高豐度表達,且與ZFP57在所有檢測組織中表達情況一致。成功構(gòu)建了綿羊TRIM28真核過表達載體p EGFP-C1-TRIM28和篩選得到有效抑制TRIM28表達的干擾si RNA,電轉(zhuǎn)染p EGFP-C1-TRIM28和si RNA的成纖維細(xì)胞中TRIM28表達改變導(dǎo)致甲基化酶基因DNMT1、DNMT3B、ZFP57、SETDB1的表達量下調(diào),但是對DNMT3A影響不大;IGF2、IGF2R、PEG1.2、PEG3、MEG8五個印記基因的表達量隨著TRIM28表達降低均表現(xiàn)出不同水平下降,隨著TRIM28表達的升高均出現(xiàn)上調(diào)。H19和DLK1兩個印記基因的表達在TRIM28表達下降和上升中均表現(xiàn)出下調(diào)。結(jié)論:綿羊TRIM28基因完整的編碼區(qū)序列與其他物種存在較高的同源性。本研究結(jié)果表明TRIM28不僅在早期胚胎發(fā)育中印記基因甲基化維持起到重要作用,而且在高度分化的成纖維細(xì)胞增殖中DNA甲基化的維持至關(guān)重要。TRIM28過表達體細(xì)胞克隆可以有效提高早期胚胎TRIM28表達量,且TRIM28過表達核移植胚胎印記基因H19和IGF2R甲基化水平高于正常核移植組,表明TRIM28對于克隆胚胎印記基因甲基化維持起到作用。
[Abstract]:Objective : To investigate the expression of TRIM28 gene in sheep ' s heart , liver , spleen , lung , kidney , muscle and ovary . The expression of TRIM28 gene was down - regulated by the expression of TRIM28 . The results showed that TRIM28 was not only the important role in the methylation of imprinting gene in early embryonic development , but also in the expression of TRIM28 . Conclusion : The expression of TRIM28 gene is very important not only in early embryo development , but also in the expression of TRIM28 . Conclusion : The expression of TRIM28 gene is very important in the expression of TRIM28 . Conclusion : The expression of TRIM28 overexpression cell can effectively improve the expression level of TRIM28 and the methylation level of TRIM28 overexpression nuclear transfer embryos is higher than that of normal nuclear transplantation group .
【學(xué)位授予單位】:石河子大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:S826
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,本文編號:1979202
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