本文選題：割手密 + 基因克隆　； 參考：《廣西植物》2017年03期

【摘要】：該研究從甘蔗細莖野生種(割手密Saccharum spontaneum)中克隆抗旱相關的基因Sc ALDH,并分析其在干旱處理條件下的表達情況和序列特征。利用RT-PCR技術克隆甘蔗的ALDH基因片段,并對其核苷酸和氨基酸序列進行分析。使用NCBI Blastx、ORF finder、Mega、NCBI Conserved Domain Search等程序對其分別進行不同物種氨基酸比較、開放閱讀框(ORF)尋找、進化樹及保守序列分析,并用Real Time-PCR分析所克隆基因在干旱脅迫前后的表達差異。結果表明:克隆出甘蔗的ALDH基因片段,總長度為1996bp,其中蛋白質編碼區(qū)(CDS)全長1524bp,編碼508個氨基酸;與其它物種ALDH類蛋白氨基酸序列有很高的同源性,有ALDH家族的保守序列,并含有完整的開放閱讀框,系統(tǒng)進化樹分析顯示與玉米的蛋白質親緣關系最近;Real timePCR數(shù)據(jù)表明,在干旱脅迫下,隨著干旱時間的延長,該基因的表達量呈持續(xù)積累的表達模式�？傮w上來說,該基因對干旱脅迫顯著表達。利用RT-PCR技術克隆的甘蔗ALDH基因,屬于ALDH蛋白家族的一員,具有其典型的功能域,該基因在干旱脅迫過程中參與抗旱作用。該研究結果為野生種資源開發(fā)、優(yōu)良抗旱親本選擇和培育抗旱性強甘蔗品種提供了參考依據(jù)。
[Abstract]:In this study, the drought-related gene SC ALDH was cloned from wild sugarcane fine stem species (Saccharum spontaneum), and its expression and sequence characteristics under drought treatment were analyzed. The ALDH gene fragment of sugarcane was cloned by RT-PCR and its nucleotide and amino acid sequences were analyzed. The amino acids of different species were compared by using NCBI Blastx ORF finder Conserved Domain Search and other programs. Open reading frame (ORF) search, phylogenetic tree and conserved sequence analysis were used to analyze the difference of expression of cloned genes before and after drought stress by Real Time-PCR. The results showed that the total length of ALDH gene of sugarcane was 1996bp.The length of protein coding region was 1524bp, encoding 508 amino acids, which had high homology with other species ALDH protein amino acid sequence and conserved sequence of ALDH family. The phylogenetic tree analysis showed that the protein phylogenetic relationship with maize was closely related to Real timePCR data. The results showed that under drought stress, the expression of the gene showed a continuous accumulation pattern with the prolongation of drought time. In general, the gene was significantly expressed under drought stress. The sugarcane ALDH gene cloned by RT-PCR technique is a member of the ALDH protein family and has its typical functional domain. The gene is involved in drought resistance during drought stress. The results provided a reference basis for the exploitation of wild species, the selection of fine drought-resistant parents and the cultivation of sugarcane varieties with strong drought resistance.
【作者單位】： 云南農(nóng)業(yè)大學農(nóng)學與生物技術學院;中國農(nóng)業(yè)科學院作物科學研究所;
【基金】：國家自然科學基金(31560417) 云南省應用基礎研究重點項目(2015FA024) 云南省現(xiàn)代農(nóng)業(yè)甘蔗產(chǎn)業(yè)技術體系建設項目(2009-2015) 云南省重點新產(chǎn)品開發(fā)計劃項目(2012BB014) 云南省高原山地作物可持續(xù)生產(chǎn)系統(tǒng)研究創(chuàng)新團隊項目(云科人發(fā)[2012]18號)~~
【分類號】：Q943.2;S566.1

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本文編號：1963761