楊樹、葡萄、擬南芥和水稻W(wǎng)RKY Ⅲ基因家族比較及表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2018-05-26 08:29
本文選題:WRKY + Ⅲ; 參考:《安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)》2016年碩士論文
【摘要】:WRKY Ⅲ基因在植物生長調(diào)節(jié)和抗逆性方面發(fā)揮重要作用。WRKY基因在很多植物中都已經(jīng)被研究報(bào)道,然而WRKY Ⅲ基因在木本植物楊樹與三個(gè)開花植物的代表家系:擬南芥、葡萄和水稻中仍缺乏一個(gè)全面的分析。楊樹作為一個(gè)大型且多年生的木本植物,與擬南芥、葡萄和水稻相比較有著不同的生命周期,其生長發(fā)育和基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)可能更加的復(fù)雜。本研究中,主要從染色體位置、系統(tǒng)發(fā)育、基因結(jié)構(gòu)、保守基序、保守的共線性、基因復(fù)制等方面四個(gè)物種的WRKY Ⅲ基因家族進(jìn)行分析,并對楊樹WRKY Ⅲ基因家族進(jìn)行同義置換率(Synonymous substitutions rate,Ks)及表達(dá)模式分析。通過研究主要獲得以下結(jié)果:1.在楊樹(毛果楊)、葡萄、擬南芥和水稻中確定出WRKY Ⅲ基因,盡管這些基因的分布是隨機(jī)的,但它們的蛋白相關(guān)理化性質(zhì)是趨向一致的。2.將57個(gè)WRKY Ⅲ基因序列進(jìn)行比對并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,結(jié)果表明這些基因可以被分成四個(gè)進(jìn)化枝(clade 1、clade 2、clade 3和clade 4),同時(shí)發(fā)現(xiàn)旁系同源基因較多,卻僅含有2對直系同源基(PtrWRKY54/VvWRKY42、PtrWRKY30/VvWRKY52)。3.基因結(jié)構(gòu)分析結(jié)果表明它們的內(nèi)含子/外顯子數(shù)量均不同,有些旁系同源基因的結(jié)構(gòu)也不同,進(jìn)化時(shí)期中發(fā)生了內(nèi)含子/外顯的丟失或者獲得事件;基序分析結(jié)果表明進(jìn)化關(guān)系比較近的蛋白在基序組成模式上相同。4.共線性結(jié)果表明楊樹和葡萄間的復(fù)制區(qū)域比擬南芥或水稻間更加的保守,每個(gè)物種內(nèi)除了全基因組復(fù)制事件還存在其他獨(dú)立的重復(fù)事件;對楊樹WRKY Ⅲ基因進(jìn)行Ks分析,結(jié)果顯示:PtrWRKYⅢ所有復(fù)制區(qū)塊都是在在單子葉植物與雙子葉植物發(fā)生分歧之后才產(chǎn)生形成的;多數(shù)PtrWRKYⅢ是通過大規(guī)模復(fù)制產(chǎn)生;強(qiáng)烈的純化選擇在維持PtrWRKYⅢ功能的進(jìn)化方面發(fā)揮著重要的作用。5.毛果楊(南林95)組織表達(dá)模式分析發(fā)現(xiàn)有5個(gè)基因(PtrWRKY30、-54、-55、-63、-90)在木質(zhì)部中表達(dá)量最高;誘導(dǎo)表達(dá)模式分析顯示,多數(shù)PtrWRKYⅢ在被100μM水楊酸(Salicylic Acid,SA)、25%聚乙二醇(Polyethylene Glycerol,PEG)6000、100μM脫落酸(Abscisic Acid,ABA)處理后的表達(dá)量發(fā)生明顯變化。
[Abstract]:WRKY 鈪,
本文編號:1936548
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