本文選題：黃精 + 實時熒光定量PCR�。� 參考：《基因組學與應用生物學》2017年11期

【摘要】：本研究采用實時熒光定量PCR(quantitative Real-t Time PCR,q RT-PCR)篩選適用于黃精(Polygonatum sibiricum)的內(nèi)參基因。利用黃精轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫,篩選8個候選內(nèi)參基因,18S核糖體r RNA基因(18S-r RNA,18S)、肌動蛋白基因(Actin,ACT)、細胞色素基因(cytochrome,CYP)、3-磷酸甘油醛脫氫酶基因(GAPDH)、α-微管蛋白基因(α-Tubulin,TUA)、β-微管蛋白基因(β-Tubulin,TUB)、多聚泛素酶基因(ubiquitin 5,UBQ 5)和(ubiquitin 10,UBQ 10)。應用q RT-PCR技術檢測這8個候選內(nèi)參基因在黃精不同組織器官中(根,根莖,莖,葉,花和種子)的表達情況。利用Ge Norm、Norm Finder和Best Keeper 3種統(tǒng)計學軟件綜合評價8個內(nèi)參基因的表達穩(wěn)定性。研究結(jié)果表明,TUB在黃精不同組織部位中表達穩(wěn)定性最好,運用q RT-PCR技術研究黃精器官基因表達時,可選用TUB作為內(nèi)參基因。確定黃精q RT-PCR分析的合適內(nèi)參基因,為后續(xù)相關基因表達研究奠定基礎。
[Abstract]:In this study, real-time fluorescence quantitative PCR(quantitative Real-t Time PCR Q RT-PCR was used to screen the internal reference gene suitable for Polygonatum sibiricum. Using the Polygonatum transcriptome database, Eight candidate internal reference genes, including 18s ribosomal r RNA gene and 18S-r RNAs, actin gene (actin), cytochrome gene (cytochrome), cytochrome gene CYPN3-phosphoglyceraldehyde dehydrogenase gene, 偽 -TubulinTUAA, 尾 -TubulinTUBU, ubiquitin 5UBQ5 and ubiquitin 10UBQ5UBQ5, were screened. Q RT-PCR technique was used to detect the expression of the eight candidate internal reference genes in different tissues and organs (root, rhizome, leaf, flower and seed) of Rhizoma Polygonatum. Three statistical softwares, GE Norm Finder and Best Keeper, were used to evaluate the expression stability of 8 internal reference genes. The results showed that the expression stability of TUB was the best in different tissues of Polygonatum chinensis. When using Q RT-PCR technique to study the gene expression in the organ of semen flavescentis, TUB could be used as the internal reference gene. To determine the appropriate internal reference gene for Q RT-PCR analysis of Rhizoma Polygonatum, and to lay a foundation for further study on the expression of related genes.
【作者單位】： 西北瀕危藥材資源開發(fā)國家工程實驗室藥用植物資源與天然藥物化學教育部重點實驗室陜西師范大學生命科學學院;
【基金】：國家自然科學基金(32170338) 陜西師范大學研究生創(chuàng)新基金項目《黃精種質(zhì)資源研究》(2015CXB010) 陜西省科技廳科技計劃項目《黃精優(yōu)良種質(zhì)資源選育及林下野生撫育技術研究》(2015SF309)共同資助
【分類號】：Q943.2;S567.239

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本文編號：1929389