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焉耆馬的DRA與DQA基因遺傳多態(tài)性及其序列分析

發(fā)布時間:2018-05-23 15:12

  本文選題:焉耆馬 + 主要組織相容性復(fù)合體; 參考:《中國畜牧雜志》2017年05期


【摘要】:采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-單鏈構(gòu)象多態(tài)性(PCR-SSCP)方法檢測焉耆馬ELA-DRA*exon2、ELADQA*exon2的基因型,并對不同等位基因進(jìn)行測序,對其核苷酸與氨基酸序列進(jìn)行分析。結(jié)果表明:焉耆馬的ELA-DRA*exon2共檢出4個等位基因;ELA-DQA*exon2共檢出9個等位基因,通過核苷酸序列比對發(fā)現(xiàn)其中3個為新等位基因。ELA-DRA*exon2、ELA-DQA*exon2的各等位基因序列分析結(jié)果表明,發(fā)生非同義替換的多態(tài)位點(diǎn)均主要分布在抗原結(jié)合位點(diǎn)對應(yīng)的編碼序列中。遺傳多態(tài)性分析結(jié)果表明,焉耆馬的ELA-DRA*exon2多態(tài)信息含量為0.4,屬于中度多態(tài)?ǚ綑z驗(yàn)結(jié)果表明,焉耆馬在該ELA-DRA*exon2位點(diǎn)處于Hardy-Weinberg平衡(χ2χ20.05)。本研究為馬的抗病育種提供了理論基礎(chǔ)。
[Abstract]:Polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism (SSCP) was used to detect the genotype of ELA-DRAexon 2 and ELADQAX exon2 in Yanqi horse. Different alleles were sequenced and their nucleotide and amino acid sequences were analyzed. The results showed that four alleles (ELA-DQAexon2) were detected by ELA-DRA*exon2 in Yanqi and 9 alleles were detected by nucleotide sequence alignment. The results of alleles analysis showed that three of the alleles were new alleles. ELA-DRAexon2ELA-DQAexon2 alleles were found to be ELA-DQAexon2 alleles. The polymorphic sites with nonsynonymous substitutions are mainly distributed in the coding sequences corresponding to antigen-binding sites. The results of genetic polymorphism analysis showed that the ELA-DRA*exon2 polymorphism information content of Yanqi was 0.4, which belonged to moderate polymorphism. The results of chi-square test showed that Yanqi was in Hardy-Weinberg equilibrium at the ELA-DRA*exon2 site (蠂 2 蠂 20.05). This study provides a theoretical basis for horse breeding for disease resistance.
【作者單位】: 新疆畜牧科學(xué)院畜牧研究所;
【基金】:新疆維吾爾自治區(qū)公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)經(jīng)費(fèi)資助項目(Ky Gy2016004) 新疆絨毛用羊遺傳育種與繁殖重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室(XJYS1105)
【分類號】:S821

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本文編號:1925281

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