陸地棉PPO基因全基因組鑒定及對黃萎病菌的響應(yīng)分析
本文選題:陸地棉 + 多酚氧化酶; 參考:《棉花學報》2017年05期
【摘要】:【目的】多酚氧化酶(Polyphenol oxidases,PPO)廣泛參與植物抵抗病蟲害等生物逆境脅迫的過程。本研究旨在研究棉花中的PPO基因及其表達模式,驗證多酚氧化酶與棉花抗黃萎病的關(guān)系!痉椒ā糠治隽它S萎病菌V991侵染下異源四倍體陸地棉TM-1根系中PPO酶活力變化,并利用TM-1的基因組數(shù)據(jù)庫,鑒定相關(guān)基因,并進行生物信息學和表達分析!窘Y(jié)果】共篩選到13個候選GhPPO基因。這些基因都不含內(nèi)含子,所編碼的蛋白包含2個銅離子結(jié)合位點和PPO的保守序列(酪氨酸酶、DWL和KFDV保守結(jié)構(gòu)域)。進化分析顯示,陸地棉PPO基因的種內(nèi)相似性大于種間相似性,并且相互之間形成了多對重復基因。GhPPO的表達量差異較大,少數(shù)基因具有組織特異表達的特性,多數(shù)基因在棉花不同組織中表達量都很低。實時熒光定量聚合酶鏈式反應(yīng)分析結(jié)果表明:GhPPO6D在棉花根系中表達量較高,且在黃萎病菌V991侵染后上調(diào)!窘Y(jié)論】GhPPO6D可能參與了棉花與黃萎病菌的互作過程,與V991侵染后棉花根系PPO酶活力上升相關(guān)。
[Abstract]:[objective] Polyphenol oxidase (PPO) is widely involved in plant resistance to plant disease and insect pests and other biological stresses. The purpose of this study was to study the PPO gene and its expression pattern in cotton, and to verify the relationship between polyphenol oxidase and cotton resistance to Verticillium wilt. [methods] the changes of PPO enzyme activity in TM-1 roots of allotetraploid upland cotton infected with Verticillium wilt strain V991 were analyzed. Using the genomic database of TM-1, the related genes were identified, and bioinformatics and expression analysis were carried out. [results] Thirteen candidate GhPPO genes were screened out. These genes contain no introns, and the encoded proteins contain two copper ion binding sites and conserved sequences of PPO (tyrosinase DWL and KFDV conserved domain). Evolutionary analysis showed that the intraspecific similarity of PPO gene in upland cotton was greater than that among species, and the expression of multiple pairs of repeat genes. A few of them had the characteristics of tissue-specific expression. The expression of most genes was very low in different tissues of cotton. The results of real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction showed that the expression of 1: GhPPO6D was higher in cotton roots and up-regulated after infection with Verticillium wilt strain V991. [conclusion] GhPPO6D may be involved in the interaction between cotton and Verticillium wilt. It was related to the increase of PPO enzyme activity in cotton roots after V991 infection.
【作者單位】: 河南大學生命科學學院/棉花生物學國家重點實驗室/河南省植物逆境生物學重點實驗室;
【基金】:棉花生物學國家重點實驗室開放課題(CB2015A31,CB2016A23)
【分類號】:S435.62
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