蕎麥屬種間13S球蛋白基因序列比較研究
本文選題:蕎麥 + S球蛋白基因; 參考:《植物遺傳資源學(xué)報(bào)》2016年03期
【摘要】:蕎麥13S球蛋白是蕎麥種子中的一類(lèi)主要貯藏蛋白。本研究選用蕎麥屬植物甜蕎栽培種及其野生類(lèi)型、苦蕎栽培種及其野生類(lèi)型、毛野蕎、左貢野蕎、細(xì)柄野蕎和硬枝萬(wàn)年蕎6個(gè)種共44份材料,進(jìn)行PCR特異性擴(kuò)增、測(cè)序得到蕎麥13S球蛋白基因的保守片段序列。對(duì)序列進(jìn)行差異分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)44份供試材料13S球蛋白基因片段的285個(gè)排列位點(diǎn)中不變位點(diǎn)為24個(gè),多態(tài)性位點(diǎn)S為261個(gè)(含簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)數(shù)198個(gè)和單型可變位點(diǎn)63個(gè)),序列總突變位點(diǎn)Eta為503個(gè)。野生甜蕎種內(nèi)13S球蛋白基因序列差異明顯高于栽培甜蕎,但野生苦蕎種內(nèi)13S球蛋白基因序列差異僅稍高于栽培苦蕎。推測(cè)其一方面可能與繁殖方式有關(guān),另一方面可能與蕎麥馴化過(guò)程中通常只有少數(shù)野生型群體被馴化有關(guān)。系統(tǒng)聚類(lèi)分析發(fā)現(xiàn)栽培甜蕎與野甜蕎親緣關(guān)系近,與左貢野蕎親緣關(guān)系次之;栽培苦蕎與野苦蕎親緣關(guān)系近,與毛野蕎親緣關(guān)系次之;細(xì)柄野蕎和硬枝萬(wàn)年蕎的13S蛋白基因片段序列差異較小,說(shuō)明其親緣關(guān)系較近。上述結(jié)果為蕎麥屬種間遺傳多樣性與進(jìn)化關(guān)系研究提供了理論依據(jù)。
[Abstract]:Buckwheat 13s globulin is one of the main storage proteins in buckwheat seeds. In this study, 44 buckwheat species and wild types of buckwheat, Tartary buckwheat cultivated species and wild types, wild buckwheat, Zigong wild buckwheat, buckwheat with fine handle and buckwheat with hard branches were used to amplify the PCR specificity. The conserved fragment of the 13s globulin gene of buckwheat was sequenced. The sequence difference analysis showed that there were 24 invariant loci in 285 loci of the 13s globulin gene fragments of 44 tested materials. The number of polymorphic loci S was 261 (including 198 parsimonic information sites and 63 single variable loci), and the total number of mutation sites (Eta) was 503. The difference of 13s globulin gene sequence in wild buckwheat was significantly higher than that in cultivated buckwheat, but the difference of 13s globulin gene in wild Tartary buckwheat was only slightly higher than that in cultivated Tartary buckwheat. On the one hand, it may be related to breeding mode, on the other hand, it may be related to the domestication of only a few wild population during buckwheat acclimation. Systematic cluster analysis showed that the relationship between cultivated buckwheat and wild buckwheat was close, followed by Zigong wild buckwheat, cultivated Tartary buckwheat and wild buckwheat followed by wild buckwheat. The difference of 13s gene sequence between wild buckwheat and Wannian buckwheat was small, which indicated that the genetic relationship was close. These results provide a theoretical basis for the study of genetic diversity and evolutionary relationship between buckwheat species.
【作者單位】: 貴州師范大學(xué)/蕎麥產(chǎn)業(yè)技術(shù)研究中心;
【基金】:國(guó)家燕麥?zhǔn)w麥現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系專項(xiàng)資金(CARS-08-A4) 國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31471562、31171609) 貴州省高層次創(chuàng)新型人才培養(yǎng)對(duì)象十百千計(jì)劃(2014GZ97588) 貴州省科技合作計(jì)劃項(xiàng)目(黔科和LH[2015]7770號(hào))
【分類(lèi)號(hào)】:S517
【參考文獻(xiàn)】
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【共引文獻(xiàn)】
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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):1903632
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