本文選題：結(jié)球甘藍(lán) + SET結(jié)構(gòu)域基因　； 參考：《安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)》2016年碩士論文

【摘要】：結(jié)球甘藍(lán)(Brassica oleracea Linn.var.capitata DC),簡稱甘藍(lán),屬于十字花科(Cruciferae)蕓薹屬(Brassica)的兩年生草本植物,世界各地均有栽培,是一種重要的葉用蔬菜類作物。植物生長發(fā)育過程中存在著保守的表觀遺傳調(diào)控機(jī)制,其中最重要的一種組蛋白修飾就是賴氨酸組蛋白甲基化,主要由一類含有SET結(jié)構(gòu)域的基因家族修飾,在真核生物中廣泛存在。植物SET結(jié)構(gòu)域基因功能復(fù)雜,它們參與蛋白甲基化,影響染色體的濃縮和分離以調(diào)控染色體結(jié)構(gòu),還參與基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)、調(diào)控基因表達(dá)等眾多的細(xì)胞反應(yīng)過程,對植物的生長發(fā)育起著重要的作用。本研究通過生物信息學(xué)分析方式,對SET結(jié)構(gòu)域基因家族的基本信息(長度、分子量、等電點等)及染色體定位、結(jié)構(gòu)域分布、基因結(jié)構(gòu)、基因的系統(tǒng)進(jìn)化等進(jìn)行分析。同時,對SET結(jié)構(gòu)域基因在結(jié)球甘藍(lán)“Bo01-12B”不同發(fā)育時期、不同器官中的時空表達(dá)圖譜進(jìn)行分析。結(jié)果表明:1.結(jié)球甘藍(lán)基因組中共有29條SET結(jié)構(gòu)域基因,這些基因不均勻的分布在甘藍(lán)9條染色體上,尤其1號染色體上沒有SET結(jié)構(gòu)域基因。29條SET結(jié)構(gòu)域基因開放閱讀框及編碼的蛋白長度各異,最長的Bol027564基因開放閱讀框長5,088bp,編碼1,695氨基酸殘基,而最短Bol044707基因開放閱讀框為405 bp,編碼134氨基酸殘基。從基因結(jié)構(gòu)來看,內(nèi)含子最少有0個,最多超過20個。其中16條SET結(jié)構(gòu)域蛋白呈堿性。2.結(jié)球甘藍(lán)中SET結(jié)構(gòu)域基因的系統(tǒng)進(jìn)化分析,結(jié)合其他保守結(jié)構(gòu)域的分布,甘藍(lán)中29條SET結(jié)構(gòu)域基因家族可分為7個分支。第I分支保守結(jié)構(gòu)域模型為SANT-SET,第II分支保守結(jié)構(gòu)域模型為AWS-SET-post-SET,第III分支保守結(jié)構(gòu)域模型為PWWP-PHD-PHD-SET-post-SET,第IV分支保守結(jié)構(gòu)域模型為PHD-SET,第V分支保守結(jié)構(gòu)域模型為SRA-pre-SET-SET,第VI分支的結(jié)構(gòu)域模型為SET-post-SET,第VII分支只含有SET一個結(jié)構(gòu)域。3.7條SET結(jié)構(gòu)域基因(Bol040761,Bol030053,Bol042363,Bol043727,Bol025176,Bol027607,Bol011910)在結(jié)球甘藍(lán)的熒光定量表達(dá)分析表明,SET結(jié)構(gòu)域基因在根、莖、花蕾、花中均有表達(dá),在葉中不表達(dá)。其中在花蕾中表達(dá)量最高,根中次之。在不同發(fā)育時期花蕾的半定量表達(dá)分析中,SET結(jié)構(gòu)域基因普遍在花粉母細(xì)胞時期高度表達(dá)。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】：安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：S635.1

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號：1897906