小白杏脂氧合酶基因PaLOX的克隆與序列分析
本文選題:小白杏 + 脂氧合酶 ; 參考:《生物技術》2017年01期
【摘要】:[目的]克隆小白杏(Prunus armeniaca)PaLOX基因全長并對其進行序列分析。[方法]根據已有的ESTs序列,設計3'和5'端RACE引物,利用RT-PCR和RACE技術克隆小白杏PaLOX基因c DNA全長。[結果]PaLOX c DNA全長序列為2 723 bp,含有一個1 002 bp的ORF開放閱讀框,編碼334個氨基酸,含有PLAT高度保守的特異結構域,預測蛋白質的相對分子質量為26.558 1 k Da,推測理化等電點為8.77,分子式為C1689H2635N459O490S13;該蛋白主要表現(xiàn)為親水性,α-螺旋和延伸鏈則散布于整個蛋白質中,空間結構不穩(wěn)定,無信號肽和跨膜結構,可能存在于線粒體中。進化分析表明,PaLOX氨基酸序列與梅、碧桃、蘋果、梨、草莓等薔薇科聚為一類,相似性依次為98%、99%、78%、77%、63%。[結論]獲得了編碼小白杏脂氧合酶的基因PaLOX全長序列,登錄號為KM067451。
[Abstract]:[objective] to clone Prunus armeniaca)PaLOX gene and sequence analysis. [methods] according to the existing ESTs sequence, the 3 'and 5' end RACE primers were designed and the full length of PaLOX gene c DNA was cloned by RT-PCR and RACE techniques. [results] the full-length PaLOX c DNA sequence was 2 723 BP, containing a 1 002 BP open reading frame of ORF encoding 334 amino acids and a highly conserved PLAT domain. The predicted molecular weight of the protein is 26.558 kDa, the predicted isoelectric point is 8.77, and the molecular formula is C1689H2635N459O490S13. The protein is mainly hydrophilic, the 偽 -helix and extension chain are scattered in the whole protein, and the spatial structure is unstable. No signal peptide and transmembrane structure may exist in mitochondria. Evolutionary analysis showed that the amino acid sequence of Palox was similar to that of the Rosaceae, such as Mei, Bitao, Apple, Pear, Strawberry, etc. [conclusion] A full-length PaLOX sequence encoding small white apricot lipoxygenase was obtained, and the accession number was KM067451.
【作者單位】: 新疆農業(yè)科學院農產品貯藏加工研究所;新疆農業(yè)職業(yè)技術學院;阿克蘇地區(qū)質量與計量檢驗所;
【基金】:國家科技支撐項目(No.2011BAD27B01-01-02) 新疆農科院青年基金項目(No.xjnkq-2014022)
【分類號】:S662.2
【參考文獻】
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【共引文獻】
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【二級參考文獻】
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本文編號:1894268
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