本文選題：鴨源雞桿菌 + OmpW基因�。� 參考：《中國獸醫(yī)學(xué)報(bào)》2017年01期

【摘要】：參考GenBank中鴨源雞桿菌(Gallibacterium anatis,G.anatis)UMN179的外膜蛋白W(outer membrane protein W,OmpW)基因序列設(shè)計(jì)1對引物,對鴨源雞桿菌PDS-RZ-1-SLG株的OmpW基因進(jìn)行克隆、測序,并通過生物信息學(xué)軟件對該蛋白結(jié)構(gòu)與功能進(jìn)行分析及預(yù)測。結(jié)果顯示:OmpW基因大小為705bp,編碼234個氨基酸;與鴨源雞桿菌UMN179株、F149株及12656/12株的OmpW氨基酸同源性分別為88.9%、78.7%和79.6%;OmpW相對分子質(zhì)量為25 300,等電點(diǎn)為7.88,是能夠穩(wěn)定存在的蛋白,N端有1個疏水性的α螺旋信號肽,C端有1個疏水性的β折疊區(qū)域,并且在外膜表面存在1個保守性的B細(xì)胞線性表位。本試驗(yàn)成功克隆了鴨源雞桿菌PDS-RZ-1-SLG株的OmpW基因,并對其結(jié)構(gòu)與功能進(jìn)行初步分析和預(yù)測,為進(jìn)一步研究其生物學(xué)功能及其應(yīng)用奠定基礎(chǔ)。
[Abstract]:A pair of primers were designed to clone and sequence the OmpW gene of PDS-RZ-1-SLG strain of GenBank, referring to the gene sequence of the outer membrane protein W(outer membrane protein Wn179 of Gallibacterium anatissimus Gallibacterium anatissima UMN179 in GenBank. The structure and function of the protein were analyzed and predicted by bioinformatics software. The results showed that the size of the 1: OmpW gene was 705bp, encoding 234 amino acids. The homology of OmpW amino acids with UMN179 strain F149 and 12656 / 12 strains were 88.9% and 79.6%, respectively. The relative molecular weight and isoelectric point of OmpW were 25 300 and 7.88 respectively. A hydrophobic beta folding region, And there is a conservative B cell linear epitope on the outer membrane. In this experiment, the OmpW gene of PDS-RZ-1-SLG strain was cloned, and its structure and function were preliminarily analyzed and predicted, which laid a foundation for further study of its biological function and its application.
【作者單位】： 河南農(nóng)業(yè)大學(xué)禽病研究所;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目資助(31302090) 河南省高�？萍紕�(chuàng)新團(tuán)隊(duì)與支持計(jì)劃資助項(xiàng)目(14IRTSHN015)
【分類號】：S852.61

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