小麥TaVIP1家族基因克
本文選題:小麥 + TaVIP; 參考:《作物學(xué)報》2017年02期
【摘要】:植物VIP1蛋白(Vir E2 interacting protein 1)與農(nóng)桿菌侵染植物后T-DNA在細(xì)胞內(nèi)的轉(zhuǎn)運有關(guān),影響植物轉(zhuǎn)化效率,但還未見有關(guān)小麥中VIP1基因研究的報道。本研究利用in silico技術(shù)從普通小麥中克隆了TaVIP1家族基因,該家族基因全部由4個外顯子構(gòu)成,編碼產(chǎn)物相似性高,與擬南芥AtVIP1蛋白質(zhì)序列相似性僅為50.7%~51.4%。Southern雜交結(jié)果表明,TaVIP1基因在小麥基因組中存在3個拷貝。根據(jù)小麥3個TaVIP1基因的差異序列設(shè)計特異引物,以四倍體小麥Langdon與中國春D組染色體代換系為材料進(jìn)行PCR檢測,結(jié)合生物信息學(xué)分析,將小麥3個TaVIP1基因分別定位在4AL、4BS和4DS染色體上。亞細(xì)胞定位分析表明,TaVIP1蛋白分布于細(xì)胞膜、細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中。農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化煙草,過表達(dá)TaVIP1基因降低了煙草轉(zhuǎn)化效率。小麥TaVIP1基因編碼的氨基酸序列與擬南芥AtVIP1基因及煙草NtVIP1基因編碼的氨基酸序列相似性很低,這可能是小麥農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化效率低的原因之一。
[Abstract]:Plant VIP1 protein Vir E2 interacting protein 1 is related to the translocation of T-DNA in the cells after Agrobacterium tumefaciens infection, which affects the efficiency of plant transformation. However, there is no report on the study of VIP1 gene in wheat. In this study, in silico technique was used to clone TaVIP1 family genes from common wheat. The family genes were all composed of four exons, and the encoding products were similar. The sequence similarity of AtVIP1 protein with Arabidopsis thaliana was only the result of 50.7%~51.4%.Southern hybridization, which indicated that there were three copies of TaVIP1 gene in wheat genome. According to the differential sequences of three TaVIP1 genes in wheat, specific primers were designed. The tetraploid wheat Langdon and Chinese spring D chromosome substitution lines were used as materials for PCR detection and bioinformatics analysis. Three TaVIP1 genes of wheat were located on 4AL4 BS and 4DS chromosomes, respectively. Subcellular localization analysis showed that TaVIP1 protein was distributed in cell membrane, cytoplasm and nucleus. Agrobacterium tumefaciens transformed tobacco, overexpression of TaVIP1 gene reduced the efficiency of tobacco transformation. The amino acid sequence of wheat TaVIP1 gene is similar to that of Arabidopsis thaliana AtVIP1 gene and tobacco NtVIP1 gene, which may be one of the reasons for the low transformation efficiency of Agrobacterium tumefaciens.
【作者單位】: 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所/國家農(nóng)作物基因資源與基因改良重大科學(xué)工程;北方民族大學(xué)生物科學(xué)與工程學(xué)院;安徽省農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物研究所;
【基金】:國家自然科學(xué)基金項目(31401380,31401376)資助~~
【分類號】:S512.1
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【共引文獻(xiàn)】
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,本文編號:1885217
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