獨(dú)行菜LaMK基因克
本文選題:獨(dú)行菜 + LaMK基因。 參考:《中國藥學(xué)雜志》2017年11期
【摘要】:目的克隆獨(dú)行菜強(qiáng)心苷生物合成途徑關(guān)鍵酶甲羥戊酸激酶(mevalonate kinase,MK)基因,進(jìn)行生物信息學(xué)分析,原核表達(dá)、純化和組織特異性分析。方法通過分析獨(dú)行菜轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),設(shè)計(jì)基因特異性引物,克隆了LaMK基因的cDNA序列,構(gòu)建p ET-32a-La MK原核表達(dá)載體,誘導(dǎo)表達(dá)LaMK重組蛋白。結(jié)果 LaMK基因的開放閱讀框(opening reading frame,ORF)全長為1 137 bp,編碼379個(gè)氨基酸。生物信息學(xué)分析顯示,La MK蛋白可能定位于細(xì)胞質(zhì)中,沒有跨膜區(qū)不含信號(hào)肽,含有GHMP激酶家族保守結(jié)構(gòu)域和ATP結(jié)合位點(diǎn)。系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示,La MK蛋白與擬南芥等十字花科植物的MK蛋白同源性較高。在大腸桿菌BL21(DE3)菌株中成功表達(dá)La MK重組蛋白,利用Ni2+親和色譜得到了純化的La MK重組蛋白。熒光定量PCR結(jié)果表明,LaMK基因在花中表達(dá)量最高,葉和根中次之,莖中較低,在幼苗中表達(dá)量最低。結(jié)論本實(shí)驗(yàn)為下一步制備La MK蛋白抗體,研究La MK基因在獨(dú)行菜強(qiáng)心苷生物合成途徑中的功能奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:Objective to clone the key enzyme mevalonate kinase- MK gene in the biosynthesis pathway of monocardioside, and analyze its bioinformatics, prokaryotic expression, purification and tissue specificity. Methods the cDNA sequence of LaMK gene was cloned by analyzing the transcriptome data of monolayer, and then the expression vector of p ET-32a-La MK was constructed to induce the expression of LaMK recombinant protein. Results the open reading reading frame ORF of LaMK gene was 1 137 BP, encoding 379 amino acids. Bioinformatics analysis showed that La MK protein may be located in the cytoplasm without signal peptide in transmembrane region, and contain conserved domain of GHMP kinase family and ATP binding site. Phylogenetic analysis showed that La MK protein had high homology with Arabidopsis and other cruciferous plants. The recombinant LaMK protein was successfully expressed in Escherichia coli BL21DE3 strain and purified by Ni2 affinity chromatography. The results of fluorescence quantitative PCR showed that LaMK gene expression was the highest in flower, followed by leaf and root, lower in stem and lowest in seedling. Conclusion this study lays a foundation for the preparation of La MK protein antibody and the study of the function of La MK gene in the biosynthesis pathway of monocardioside.
【作者單位】: 河南中醫(yī)藥大學(xué)藥學(xué)院;呼吸疾病診療與新藥研發(fā)河南省協(xié)同創(chuàng)新中心;
【基金】:國家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃“973計(jì)劃”項(xiàng)目(2013CB531802) 河南省科技攻關(guān)計(jì)劃(162102310468) 河南中醫(yī)學(xué)院博士科研基金(BSJJ2011-07)
【分類號(hào)】:Q943.2;S567.2
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,本文編號(hào):1853337
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