大白菜表皮毛控制基因Brtri1的精細定位與候選基因分析
本文選題:大白菜 + 表皮毛 ; 參考:《沈陽農業(yè)大學》2016年碩士論文
【摘要】:大白菜(Brassica campestris L.ssp. pekinensis,染色體組AA,2n=2x=20)是我國種植面積最大、產量最高的蔬菜作物。表皮毛是植物表皮的衍生結構,是研究植物細胞分化的理想系統(tǒng)。本文通過利用無表皮毛大白菜DH系‘FT’和有表皮毛DH系'PurDH-1'構建分離群體,克隆了1個控制大白菜表皮毛的候選基因。1.利用‘FT’和'PurDH-1'雜交,構建了包含5027個單株的F2分離群體,其中3801個單株有表皮毛,1226個單株無表皮毛,證實大白菜有表皮毛性狀受單顯性基因控制,命名為Brtril。2.利用F2分離群體中的1226株無表皮毛植株作為定位群體,最終將Brtril定位在A06染色體上分子標記pur6-31與pur6-39之間,物理距離為16.84 kb。基因預測表明,該該區(qū)域共有4個完整的ORF。其中,Bra025311編碼MYB轉錄因子,與擬南芥表皮毛調控基因GLl高度同源。因此,將Bra025311作為Brtril的候選基因。3.序列分析表明,‘FT’中Bra025311基因的第3外顯子發(fā)生5bp的缺失事件,造成移碼突變。4.表達模式分析表明,Bra025311在'PurDH-1'正常表達,但是在‘FT’上不表達。5.利用第三外顯子的序列差異,開發(fā)出1個共顯性Indel標記,能夠有效區(qū)分雜合基因型和純合基因型,可用于無表皮毛性狀的分子標記輔助選擇。
[Abstract]:Chinese cabbage (Brassica campestris L.ssp. pekinensis) is the largest vegetable crop in China. Epidermis is a derived structure of plant epidermis and an ideal system for studying plant cell differentiation. In this paper, a candidate gene for controlling epidermal hair of Chinese cabbage (Brassica campestris L.) was cloned by using the DH line FT' and the epidermal DH line PurDH-1'of Brassica campestris L. A F2 segregation population of 5027 plants was constructed by using FT' and PurDH-1' hybrids, of which 3801 plants had epidermal hairs and 1226 plants had no epidermal hairs. It was confirmed that the epidermal traits of Chinese cabbage were controlled by a single dominant gene, named Brtril.2. Using 1226 epidermal fur plants from F _ 2 segregated population as the mapping population, the Brtril was mapped between the molecular marker pur6-31 and pur6-39 on chromosome A06, and the physical distance was 16.84 kb. Gene prediction showed that there were four complete ORFs in this region. Bra025311 encodes MYB transcription factor, which is highly homologous to Arabidopsis epidermal regulatory gene GLl. Therefore, Bra025311 is used as the candidate gene of Brtril. Sequence analysis showed that 5bp deletion occurred in exon 3 of Bra025311 gene, resulting in frameshift mutation. 4. The expression pattern analysis showed that Bra025311 was expressed normally in PurDH-1', but not in FT'. Using the sequence difference of exon 3, a codominant Indel marker was developed, which can effectively distinguish heterozygous genotype from homozygous genotype, and can be used for molecular marker-assisted selection of fur traits without surface.
【學位授予單位】:沈陽農業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:S634.1
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,本文編號:1851840
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