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灰飛虱雌激素相關(guān)受體基因的克

發(fā)布時(shí)間:2018-05-05 22:55

  本文選題:灰飛虱 + 雌激素相關(guān)受體; 參考:《昆蟲學(xué)報(bào)》2017年03期


【摘要】:【目的】雌激素相關(guān)受體(estrogen-related receptor,ERR)是一類依賴配體激活的轉(zhuǎn)錄因子,能感受外源物質(zhì)脅迫調(diào)控靶基因的轉(zhuǎn)錄,參與外源物質(zhì)的代謝過程。本研究旨在通過克隆灰飛虱Laodelphax striatellus ERR基因,分析其序列和在氟啶蟲胺腈脅迫下表達(dá)譜,探析其生理功能及在殺蟲劑代謝中的作用!痉椒ā扛鶕(jù)灰飛虱轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)信息,利用RT-PCR克隆灰飛虱ERR基因,并進(jìn)行生物信息學(xué)分析;通過實(shí)時(shí)熒光定量PCR,分析暴露于氟啶蟲胺腈(0.76 ng/頭)后,灰飛虱4齡若蟲ERR基因在不同時(shí)間點(diǎn)和不同組織中的表達(dá)量!窘Y(jié)果】從灰飛虱中克隆到ERR基因,命名為L(zhǎng)s ERR(Gen Bank登錄號(hào):KY210878),其c DNA序列全長(zhǎng)1 854 bp,開放閱讀框長(zhǎng)1 260 bp,編碼419個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)編碼蛋白的分子量為47.70 k D。序列分析顯示,Ls ERR具有核受體(nuclear receptors,NRs)家族成員的共同特征性結(jié)構(gòu):DNA結(jié)合區(qū)(DNA-binding domain,DBD)(第75-168位氨基酸)和配體結(jié)合區(qū)(ligand-binding domain,LBD)(第194-416位氨基酸)。采用APSSP2法預(yù)測(cè)Ls ERR蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu),其中α螺旋占43.53%,β折疊占5.49%,無規(guī)則卷曲占50.98%。其中,在DBD區(qū),有6個(gè)β折疊和3個(gè)α螺旋;在LBD區(qū),有3個(gè)β折疊和11個(gè)α螺旋。系統(tǒng)發(fā)育分析表明,Ls ERR與褐飛虱Nilaparvata lugens ERR親緣關(guān)系最近;绎w虱4齡若蟲暴露于氟啶蟲胺腈后,12 h時(shí)其體內(nèi)Ls ERR基因上調(diào)表達(dá),24 h時(shí)達(dá)到表達(dá)高峰,48 h時(shí)表達(dá)量下調(diào);Ls ERR在頭部微弱表達(dá),在腹部特異性高表達(dá)。【結(jié)論】Ls ERR是參與灰飛虱代謝氟啶蟲胺腈的候選基因。本研究為解毒酶基因的調(diào)控和新分子靶標(biāo)農(nóng)藥的研制提供分子基礎(chǔ)。
[Abstract]:[objective] estrogen-related receptor ERR (ERR) is a ligand-activated transcription factor, which can regulate the transcription of target gene and participate in the metabolism of exogenous substance. The purpose of this study was to clone the Laodelphax striatellus ERR gene of planthopper, analyze its sequence and expression profile under flurazidonitrile stress, and explore its physiological function and its role in insecticide metabolism. [methods] according to the information of transcriptome data of fly planthopper, The ERR gene was cloned by RT-PCR and analyzed by bioinformatics. The expression of ERR gene of 4th instar nymph in different time points and in different tissues. [results] ERR gene was cloned from the plant planthopper. The c DNA sequence is 1 854 BP in length, and the open reading frame is 1 260 BP, encoding 419 amino acids. The predicted molecular weight of the encoded protein is 47.70 KD. Sequence analysis showed that the ERR had the common characteristic structure of the nuclear receptor NRs1 family members. The DNA binding domain of ERR was the 75-168 amino acids and the ligand binding domain of ligand binding domain LBDD (the 194-416 amino acid). The secondary structure of Ls ERR protein was predicted by APSSP2 method. 偽 helix accounted for 43.53%, 尾 fold for 5.49% and irregular crimp for 50.98%. Among them, there are 6 尾 folds and 3 偽 helix in DBD region and 3 尾 fold and 11 偽 helix in LBD region. Phylogenetic analysis showed that ERR had the closest relationship with Nilaparvata lugens ERR. The expression of Ls ERR gene in the 4th instar nymphs was down-regulated at 24 h after exposure to fludiconitrile and reached the peak at 48 h after exposure to fludiconitrile. [conclusion] Ls ERR is a candidate gene involved in the metabolism of fluazolidonitrile in planthopper. This study provides a molecular basis for the regulation of detoxifying enzyme gene and the development of new molecular target pesticides.
【作者單位】: 江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所;南京農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院農(nóng)作物生物災(zāi)害綜合治理教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;淮北師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【基金】:江蘇省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(BK20150539) 國(guó)家科技支撐計(jì)劃課題(2012BAD14B12-5) 江蘇省農(nóng)業(yè)科技自主創(chuàng)新資金(CX(15)1004) 農(nóng)作物生物災(zāi)害綜合治理教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開放課題基金(IMCDP201603)
【分類號(hào)】:Q78;S433

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):1849639

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