本文選題：大豆 + 油脂合成　； 參考：《華北理工大學(xué)》2016年碩士論文

【摘要】：目的對大豆和擬南芥、苜蓿、百脈根、番茄、葡萄6個雙子葉植物的全基因組進行比較基因組學(xué)系統(tǒng)發(fā)育分析,確定油脂合成基因家族,大豆油脂合成基因受環(huán)境的選擇情況,發(fā)生基因丟失和基因置換進行遺傳重組,探索大豆油脂合成基因家族的適應(yīng)性進化規(guī)律。方法以大豆、擬南芥、苜蓿、百脈根、番茄、葡萄為研究對象,同源比對搜索確定油脂合成基因家族成員,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。利用共線性分析軟件對物種基因內(nèi)、物種間的同源染色體片段進行推斷,結(jié)合同源基因組結(jié)構(gòu)分析,確定多倍化產(chǎn)生的重復(fù)基因片段。對油脂合成基因進行正選擇分析、基因置換分析,結(jié)合多倍化產(chǎn)生的重復(fù)基因的特征,推斷該基因家族適應(yīng)性進化與多倍化的關(guān)系。結(jié)果在大豆、擬南芥、苜蓿、百脈根、番茄、葡萄中篩選4215個油脂合成基因,其中大豆有1259個基因。基因組同源結(jié)構(gòu)分析,發(fā)現(xiàn)大豆自身、大豆和其他5個物種存在大量的DNA重復(fù)片段;大豆1259個油脂合成基因中有16.68%的基因參與基因轉(zhuǎn)換,80.04%的基因處于全基因組加倍的共線性區(qū)。正選擇分析結(jié)果表明,大豆中的部分油脂合成基因受到了正選擇影響。結(jié)論基因組加倍事件產(chǎn)生的重復(fù)基因為家族進化提供遺傳基礎(chǔ),油脂合成基因在不同程度上受到了正選擇,以此更好的適應(yīng)環(huán)境。
[Abstract]:Objective to analyze the whole genomes of soybean and Arabidopsis thaliana, alfalfa, vermilion root, tomato and grape in order to determine the gene family of oil synthesis and the selection of soybean oil biosynthesis gene by environment. Genetic recombination of gene loss and gene exchange was carried out to explore the adaptive evolution of soybean oil biosynthesis gene family. Methods Soybean, Arabidopsis thaliana, alfalfa, vermilion root, tomato and grape were used as research objects. Homology comparison search was used to identify the members of oil synthesis gene family and to construct phylogenetic tree. The homologous chromosomal fragments within and between species genes were inferred by co-linear analysis software, and the repeat gene fragments produced by polyploidy were determined with homologous genomic structure analysis. The relationship between adaptive evolution and polyploidy of the gene family was inferred by positive selection analysis, gene replacement analysis, and the characteristics of repeat genes produced by polyploidy. Results 4215 genes of oil synthesis were screened in soybean, Arabidopsis thaliana, alfalfa, vermilion root, tomato and grape, among which there were 1259 genes in soybean. A large number of DNA repeats were found in soybean itself, soybean and other 5 species, and 16.68% of the 1259 genes involved in gene transformation were found to be in the colinear region of the whole genome doubling. The results of positive selection analysis showed that some oil synthesis genes in soybean were affected by positive selection. Conclusion the duplicates produced by genome doubling events provide the genetic basis for family evolution, and the genes of oil synthesis are selected in different degrees, so that they can adapt to the environment better.
【學(xué)位授予單位】：華北理工大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：Q943.2

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本文編號：1849501